糖の構造と種類、性質
Biochemistry 101: Carbohydrates (Lecture 6 of 12) The Immunerd チャンネル登録者数 308人
グルコース-アラニン回路とコリ回路(乳酸回路)との違いを考える前に、もっと大きく物事を捉えることにします。そのほうが理解しやすいですし、忘れにくいと思うので。
そもそも人間はどうやってエネルギー(エネルギー通貨であるATP)を得ているのかというと、グルコースの分解(解糖系)とそれに続く(酸素が利用できる場合)クエン酸回路を利用することによってでした。エネルギー供給源としてグルコースが必要なのです。ただし、クエン酸回路に入る分子はアセチルCoAなので、脂肪酸分解など他の経路からアセチルCoAが作れる場合は、グルコースがなくてもエネルギーが取り出せます。また脳では、脂肪酸が脳血管関門を通れないためにグルコース以外としてはケトン体が利用されることもあります。
そのような事情から、グルコースは主要なエネルギー源だと言えます。食事して炭水化物(糖質)を栄養源にできるときは、小腸まででグルコースにまで分解されて、グルコースが小腸で吸収され血流に入って全身の組織に供給されるので、異化反応(分解反応)によってグルコースを代謝してエネルギーを取り出すことができます。
問題は食事してしばらくたったあと、あるいは、激しい運動をしてグルコースが枯渇してきた場合です。エネルギー源の貯蔵形態であるグリコーゲンや脂肪酸も枯渇してくると、なんとかしてグルコースを作らなければなりません。そのような状況で働くのが「糖新生」の代謝経路で、肝臓で主として起こります。「糖新生は肝臓で起こる」というのが一つ大事なポイント。なぜかというと、グルコース-6リン酸からグルコースになるステップ(糖新生の最終ステップであり、解糖系の最初のステップでもある)に必要な酵素グルコース-6-ホスファターゼが筋肉には存在せず、肝臓にあるためです。解糖系でグルコースがグルコース6リン酸になるときに働く酵素は別あって、ヘキソキナーゼという酵素でした。一般的に化学反応は可逆反応だといわれますが、なぜヘキソキナーゼが逆反応を触媒できないのかというと、それはこの反応の自由エネルギー変化の大きさのせいです。自由エネルギー変化が0に近い場合は、可逆反応になります。自由エネルギー変化が非常に大きい(グルコースとATPがグルコース6リン酸とADPになる場合のΔG=-33.4 kJ/mol)ので、逆変化のΔG=+33.4 kJ/molとなり逆反応が起きなくなります。
Overall, the irreversible nature of the hexokinase-catalyzed reaction is an important feature of glucose metabolism, as it ensures that glucose is rapidly and efficiently converted to glucose-6-phosphate for energy production, and that glucose-6-phosphate is effectively trapped within the cell for further metabolism.
すると、糖新生を肝臓で行うための、出発材料は何で、どこで手にはいるのかということが問題になります。筋肉では酸素が利用できない条件下では解糖系でピルビン酸からさらに乳酸にまでなります。この乳酸が血液を通って肝臓に運ばれて、肝臓における糖新生の出発材料になります。肝臓でできたグルコースは再び血中を通って筋肉に戻されてエネルギー源として使われます。これで、回路が完成しますので、乳酸回路(コリ回路)と呼ぶのです。
筋肉では解糖系でできたピルビン酸が乳酸にならずにアミノ基が付加されてアラニンになる経路もあります。
ピルビン酸 CH3-C(=O)-COOH + グルタミン酸H2N-CH(-COOH)-CH2-CH2-COOH
→ アラニンCH3-C(-NH2)-COOH +αケトグルタル酸 C(=O)(-COOH)-CH2-CH2-COOH
このアラニンが血液中を通って肝臓に運ばれて、糖新生の出発材料になります。
コリ回路:(筋肉)グルコース→ピルビン酸→乳酸(血中、肝臓)→グルコース(血中、筋肉)
グルコースアラニン回路:(筋肉)グルコース→ピルビン酸→アラニン(血中、肝臓)→グルコース(血中、筋肉)
こうして書き比べると、肝臓での糖新生の出発材料が筋肉で得られる乳酸かアラニンかという違いしかないことがわかります。
ちなみに筋肉中のグルタミン酸は、αケトグルタル酸にアミノ基転移が起きることで生じます。じゃあ、そのアミノ基はどこからくるかというと、筋肉でタンパク質がアミノ酸にまで分解され、そのアミノ酸がαケト酸になるときに生じるアミノ基です。
アミノ酸H2N-CH(-COOH)-側鎖 +αケトグルタル酸 C(=O)(-COOH)-CH2-CH2-COOH
→ αケト酸 C(=O)(-COOH)-側鎖 + グルタミン酸H2N-CH(-COOH)-CH2-CH2-COOH
ちなみに肝臓でアラニンがつかわれるとき、炭素骨格は糖新生に使われますが、窒素の部分は尿素になり最終的に尿として排出されます。
人工知能ChatGPT(https://chat.openai.com/chat)に聞いてみます。
質問:When alanine is preferred and when lactate is prefferred in gluconeogenesis as a starting materials?
回答:
In gluconeogenesis, both alanine and lactate can be used as starting materials for glucose synthesis, but their utilization is dependent on the specific metabolic conditions. Alanine is typically preferred as a starting material in gluconeogenesis when there is a high demand for glucose and when amino acids are being mobilized from muscle tissue. During intense exercise or prolonged fasting, skeletal muscle breaks down protein to release amino acids, including alanine. Alanine is then transported to the liver where it is converted to pyruvate and used in gluconeogenesis to produce glucose. The conversion of alanine to pyruvate also generates ammonium ions, which can be incorporated into the urea cycle and excreted in urine. Thus, alanine is an important source of both glucose and nitrogen during times of high energy demand. Lactate, on the other hand, is preferred as a starting material in gluconeogenesis when there is a high demand for glucose and a shortage of oxygen. During intense exercise, the demand for ATP exceeds the supply of oxygen, leading to the production of lactate via anaerobic metabolism. Lactate is then transported to the liver, where it is converted to pyruvate and used in gluconeogenesis to produce glucose. This process is important for maintaining blood glucose levels during periods of intense exercise or hypoxia.
Overall, the utilization of alanine or lactate in gluconeogenesis is dependent on the metabolic state of the organism and the specific demands for glucose production.
今や人工知能ChatGPTは、米医師資格試験に合格できるくらいの実力なのだそうです。
そこで、ChatGPT(https://chat.openai.com/chat)にグルコース-アラニン回路とコリ回路(乳酸回路)との違いについて聞いてみました。
質問:What is the difference between glucose-alanine cycle and glucose-lactate cycle?
回答:
The glucose-alanine cycle and the glucose-lactate cycle are two different metabolic pathways that occur in the body during periods of intense exercise or prolonged fasting.
The glucose-alanine cycle, also known as the Cori cycle, is a metabolic pathway that occurs in the liver and skeletal muscles. During periods of intense exercise, skeletal muscles break down glycogen to produce glucose. The glucose is then transported to the liver, where it is converted to pyruvate and then to alanine, which is released into the bloodstream. The alanine is transported back to the skeletal muscles, where it is converted back to pyruvate and used to regenerate glucose through gluconeogenesis. The glucose is then transported back to the liver, completing the cycle. ん?よくわからないせつめい。
In contrast, the glucose-lactate cycle, also known as the Lactic acid cycle, is a metabolic pathway that occurs in the skeletal muscles. During periods of intense exercise, the skeletal muscles break down glycogen to produce glucose, which is then converted to pyruvate through glycolysis. Under conditions of low oxygen, pyruvate is converted to lactate instead of being further metabolized to produce energy. The lactate is then transported to the liver, where it can be converted back to glucose through gluconeogenesis.
The key difference between the two cycles is the end product that is transported from the muscles to the liver. In the glucose-alanine cycle, alanine is transported, whereas in the glucose-lactate cycle, lactate is transported. Additionally, the glucose-lactate cycle occurs entirely within the skeletal muscles and liver, while the glucose-alanine cycle occurs between the liver and skeletal muscles. これもよくわからない説明
筋肉に存在した物質を利用して、肝臓で糖新生を行うことで筋肉へのグルコースを供給する回路として、グルコース-アラニン回路と似たものとしてコリ回路というものがありました。コリ回路は別名、乳酸回路とも呼ばれることからわかるように、無酸素運動により筋肉中でできた乳酸を肝臓に送ってグルコースに変えて、また筋肉に戻して利用するものです。ハーバーの生化学の教科書にはこれら2つの回路を一つの図としてまとめたものが掲載されていてわかりやすかったのですが、2つ同時に、2つの違いに注意しながら勉強するのがお勧めです。
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ご飯を食べると唾液内のアミラーゼや膵臓から分泌されたアミラーゼの腸管における作用によって炭水化物がグルコースにまで分解されて、腸管の上皮細胞からグルコースが吸収され血流に入ります。血液中のグルコースの濃度、すなわち血糖値が上昇すると、膵臓のランゲルハンス島(膵島とも呼ばれる)にあるβ細胞がそれを検知してホルモンの一種であるインスリンを分泌し、インスリンは血流にのって全身の細胞にグルコースを取り込むように指令を出します。そうすることで血糖値が下がり、血糖値が一定の範囲内に調節されるわけです。
インスリンが全身の細胞に働きかけるためには、血管の中から組織のほうに出ていく必要があります。血管の一番内側は血管内皮細胞があるわけですが、どのようにして血管を出ていくのでしょうか。
そのメカニズムはというと、血管内皮細胞の表面にはインスリン受容体があり、血流の中のインスリンはこのインスリン受容体に結合することによって、血管内皮細胞の中にいったん取り込まれ、反対側に移動して血管の外に出ていくか(transcytosis)、もしくは、血管内皮細胞と血管内皮細胞との間をすり抜けて移動していく(paracellular diffusion)という2つのメカニズムが想定されています。
細胞の代謝活動は,血管を循環する血液により供給される糖や酸素などにより支えられている.体の大部分においては,これらの物質は血管壁を容易に通過して組織へと浸透していく.しかしながら,脳など一部の器においては血液と組織細胞の間に関門が形成され,このような自由な物質の移動が妨げられている。この「血液一組織関門」(blood-tissuebarriers)の存在により得られる特殊な環境は,光にする透明度が要求される眼球をはじめとして,その器特有の機能の発揮に大きく寄与している.それでは,関門で取りまれた細胞へはどのようにして栄養が届くのであろうか.ここでは,最近明らかになった糖輸送体GLUT1やギャップ結合蛋白質コネキシンの関与する糖の関門通過機構について,関門の構造とも関連づけながら述べる. https://www.jstage.jst.go.jp/article/kenbikyo1950/33/2/33_2_99/_pdf
全ての細胞は解糖系を持っていてグルコースを代謝してエネルギーを取り出しています。細胞がグルコースを細胞外から取り込むときにグルコーストランスポーター(輸送体)Glucose Transporter (GLUT)が働きますがGLUTには1サブタイプがあります。
GLUT2は他のサブタイプに比べると比較的グルコースに対して低親和性を示し、グルコースが高濃度になったときに膵臓のβ細胞に取り込まれて、糖代謝によりATPが産生されてATP依存的カルシウムチャネルが開いて細胞外から細胞内へとカルシウムイオンが流入し、カルシウム依存的な膜小胞の開口が生じるのでインスリンが分泌されます。
GLUT2は肝臓細胞でブドウ糖の出入り制御を助けている。また、膵臓のβ細胞における血中ブドウ糖濃度の監視にも使われていて、濃度が上がったことを検知するとインスリン(insulin)が放出される。
https://numon.pdbj.org/mom/208?l=ja
GLUT4 is an insulin-dependent GLUT (Brosius et al., 1992; Cooper et al., 1993; Standley and Rose, 1994; Kahn et al., 1995; Banz et al., 1996) whereas GLUT2 is, in contrast, an insulin-independent transporter (Pyla et al., 2013).
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7522350/
In the human body, glucose uptake is accomplished via two mechanisms, insulin mediated glucose uptake (IMGU), which occurs only in insulin-sensitive tissues (i.e. liver, muscle and adipocytes) and non-insulin mediated glucose uptake (NIMGU), which occurs in both insulin-sensitive and non-insulin-sensitive tissues (i.e., brain, blood cells, nerve, etc.).
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2894300/
GLUT1 is insulin-independent and is widely distributed in different tissues. GLUT4 is insulin-dependent and is responsible for the majority of glucose transport into muscle and adipose cells in anabolic conditions.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9801136/
GLUTs 1, 3, and 4 are transporters that have high affinity for glucose ranging in Km of 2–5 mM glucose. Consequently, the functions of these transporters align with the physiological concentration of glucose of about 5 mM. On the other hand, GLUT2 has a low affinity for glucose with its Km of about 15–20 mM glucose. GLUT2, therefore, is able to move glucose into the liver cell and the pancreatic beta cell in proportion to the plasma level of glucose.
https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/glut4
An auxiliary function of some GLUTs in the liver seems to be the transport of dehydroascorbic acid (DHA), the oxidized form of ascorbic acid (AA, vitamin C) as described for the GLUT isoforms GLUT1, GLUT3, and GLUT4 [188]. The last-mentioned glucose transporter GLUT4 is known as major isoform in muscular and adipose tissues and only shows minor expression levels in the liver as well [228].
https://link.springer.com/article/10.1007/s00424-020-02417-x
GLUT-2 (SLC2A2) also transports other dietary sugars such as galactose, mannose and fructose with a high affinity for glucosamine[11,24,25]. GLUT-2 is highly expressed in the liver, pancreatic beta cells, and on the basolateral surface of kidney and small intestine epithelia[26,27] with expression regulated by sugars and hormones[23,28].
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3520166/
過敏性腸症候群は原因が不明の病気で、現在活発に病態や病因に関する研究が進められています。科研費研究でどのようなものがあるのか調べてみました。
ビタミンCは、ビタミン13種類の中でも一番有名だと思います。メジャーな役割は働きは2つあります。1つめは、有名な抗酸化作用。2つめは、コラーゲンを水酸化(ーOH基をつける)する反応に必要な補酵素として。コラーゲンは水酸化されて初めて正常な機能を持ちます。コラーゲンは、歯肉(歯ぐきのこと)など結合組織を構成する重要な成分。そのため、ビタミンCが欠乏するとコラーゲンが機能しない、すなわち正常な結合組織ができないことになり、非常に重大な結果を引き起こします。ビタミンC欠乏症は、壊血病(かいけつびょう)とも呼ばれ、歯肉炎や皮下出血などの症状を呈します。
血管は場所によって太さが違います。細い毛細血管の場合は、一番内側は血管内皮細胞で、その外がわには「血管壁」を構成する細胞があります。血管内日斎藤と血管壁の細胞の間には「基底膜」と呼ばれる膜があり、基底膜はコラーゲンでできています。もっと太い血管の場合は、内膜、中膜、外膜という三層構造をしており、外膜と中膜はコラーゲンやエラスチンでできています。これ‐減は血管を構成する非常に重要なタンパク質なのです。
壊血病とは血管がもろくなり出血する病気です。口や鼻から多く出血し、いかにも血液が壊れていくような症状であったことから壊血病と呼ばれるようになりました。(ビタミンCの必要性~歴史から見るビタミンC~ 分子生理科学研究所)
ビタミンCは、ジオキシゲナーゼという水酸化酵素の補因子としても重要です。ビタミンC欠乏症(壊血病)で血管がもろくなるのは、血管を構成するコラーゲン繊維ができなくなることが原因です。コラーゲンは、プロリンとリシンが水酸化されることで繊維構造をつくれるようになります。
細かい話ですが根源的な部分を知れば、全体が統一的に理解できるようになります。まさに生化学は医学の土台ですね。
ビタミンCの構造式をみると、なんとなくグルコースに似ていると感じます。それも当然で、ビタミンCを合成することができる植物や動物(人を含む霊長類は合成できない)は、グルコースを出発材料にビタミンCを作っているから当然、構造が似ているわけです。グルコースの化学式はC6H12O6ですが、ビタミンCの化学式はそれから水素Hが4つなくなっただけでC6H8O6です。
ビタミンCがグルコースからつくられることを知っていれば、上のケムステの問題は超簡単です。
ビタミンCってどんな構造? なぜグルコース(ブドウ糖)に近いの? 他に似たようなものってなに? ビタミンC研究委員会 https://vc-research.info/wisdom/w_01.html
- 1927年 アルベルト・セント-ジョルジSzent-Györgyiが還元性物質を純粋な結晶として分離し、分子式(C6H8O6)、炭素数6個の糖でかなり強い酸性を示すことからヘキスウロン酸(hexuronic acid)と命名
- 1932年4月 CHEMICAL NATURE OF VITAMIN C C G King, W A Waugh Science 1932 Apr 1;75(1944):357-8. doi: 10.1126/science.75.1944.357-a
- 1932年4月 Hexuronic Acid as the Antiscorbutic Factor J. L. Svirbely, A. Szent-Györgyi Published in Nature 1932 semanticscholar.org
- 1933年 英ハワースがヘキスウロン酸の分子構造を決定し、アスコルビン酸Ascorbic Acidと命名
- 1933年 スイスのタデウシュ・ライヒスタインがビタミンCの化学合成に成功
- 1937年 Nobel Prizein in Chemistry for Haworth
- 1937年 Nobel Prize in Physiology and Medicine for Szent-Györgyi
なぜビタミンCの性質を調べたKingとWaughはノーベル賞を受賞しなかったのかと不思議に思ってChatGPTに訊いてみました。
C.G. King and W.A. Waugh were instrumental in the early characterization and isolation of vitamin C, but they were not awarded the Nobel Prize because their contributions were primarily focused on isolation and identification, whereas the Nobel Committee tends to prioritize groundbreaking achievements in synthesis, structural determination, and broader scientific implications.
Key Factors Behind the Nobel Prize Decision:
- Synthetic Achievement and Structural Elucidation:
- Norman Haworth was awarded the Nobel Prize in Chemistry in 1937 for his work in determining the exact molecular structure of vitamin C and related carbohydrates.
- Tadeusz Reichstein synthesized vitamin C chemically (the Reichstein process) in 1933, making large-scale production feasible. This synthesis had significant industrial and public health implications.
- Scope of Contribution:
- While King and Waugh successfully isolated and identified vitamin C from natural sources (such as lemon juice), this was seen as a biochemical characterization rather than a novel synthesis or structural breakthrough.
- The Nobel Committee often emphasizes contributions that lead to new methodologies or synthetic pathways that reshape scientific fields or industries.
- Historical Context and Recognition Bias:
- At the time, there was a greater emphasis on the chemical synthesis and structural analysis of compounds. This might have overshadowed the contributions of researchers focused on biological or nutritional studies.
- Although King and Waugh’s work was crucial, the synthesis by Reichstein and the structural elucidation by Haworth were viewed as the culminating achievements that had broader scientific and practical impact.
Recognition of King and Waugh’s Work:
- C.G. King’s work on vitamin C isolation was widely recognized in the scientific community and contributed significantly to understanding nutrition and preventing scurvy.
- However, in terms of Nobel-level impact, the ability to synthesize vitamin C and understand its exact structure was seen as the critical step forward.
In summary, the Nobel Prize reflected the synthetic and structural breakthroughs rather than the initial isolation and identification of vitamin C, which explains why King and Waugh were not recipients.
タデウシュ・ライヒスタインがノーベル賞受賞者に含まれなかったのも不思議で、訊いてみました。
Interestingly, Tadeusz Reichstein was not awarded the Nobel Prize for his synthesis of vitamin C, despite his groundbreaking contribution to the field of organic chemistry and the industrial production of vitamin C.
Why Wasn’t Reichstein Awarded the Nobel for Vitamin C?
- Focus of Nobel Recognition: In 1937, the Nobel Prize in Chemistry was awarded to Norman Haworth for his work on carbohydrates and the structural elucidation of vitamin C.
- At the same time, Albert Szent-Györgyi received the Nobel Prize in Physiology or Medicine for his discovery of vitamin C and its biological functions.
- Reichstein’s synthetic work, while critical, was seen more as a technical and industrial achievement rather than a pioneering physiological or structural discovery.
Why Might Reichstein Have Felt Overlooked?
- The Scale of His Contribution: Reichstein’s synthesis of vitamin C was seen as a significant achievement in organic chemistry, and many considered it on par with or even surpassing the contributions of Norman Haworth and Albert Szent-Györgyi in terms of practical impact.
- Recognition of Others: While Haworth and Szent-Györgyi were recognized, Reichstein’s work was acknowledged more in the industrial and chemical fields rather than in the realm of physiology or structural discovery, which were the focus of the 1937 prizes.
- Technical vs. Scientific Emphasis: The Nobel Committee may have viewed Reichstein’s work as more of a technical achievement, whereas Haworth’s elucidation of vitamin C’s structure was seen as a theoretical breakthrough that aligned more closely with the Nobel’s emphasis on advancing scientific knowledge.
Reichstein’s Nobel Prize (Later Recognition):
- Tadeusz Reichstein eventually received the Nobel Prize in Physiology or Medicine in 1950 – but not for vitamin C. He was awarded the prize for his work on the corticosteroid hormones of the adrenal cortex, including the synthesis of cortisone.
- His contributions to steroid chemistry had profound implications for treating conditions like rheumatoid arthritis and other inflammatory diseases.
Key Takeaway:
Reichstein’s role in vitamin C synthesis was pivotal for public health and industry, but the Nobel Prize for vitamin C was reserved for Haworth and Szent-Györgyi, whose contributions aligned more directly with the Prize’s emphasis on structural elucidation and physiological impact. Reichstein’s later work in hormone synthesis was the achievement that ultimately earned him Nobel recognition.
ReichsteinはビタミンCの合成ではノーベル賞を逃しましたが、その後、糖質コルチコイドの仕事でノーベル賞を受賞していたんですね。一生の間にノーベル賞級の仕事をいくつもしたというのが、圧倒的です。
下の図の①がグルコースです。
暴力と引きこもりは、親和性が高い
一過性の暴力
- 50%程度に一過性の暴力
- 親が自分をコントロールしようとしていることに非常に敏感で怒りを感じる
- 本人の人格を否定したり、怠け者扱いをしたり、「早く仕事をしろ」などと追い詰められると、それに対する反発として暴力が起こる
- 家族に、本人に対する批判や否定をやめてもらう
慢性的な暴力
- 10%弱のケースに慢性的な暴力
- 慢性型の暴力は比較的やっかい
- これまでの人生に対してすごく否定的な思いが渦巻いていて、他責的になりやすい。親にぶつけずにいられなくなってしまう これが慢性的な暴力の根源
- 親に「自分の苦しさを味わえ」「共感せよ」と言っている
- 根源にあるのは怒りや攻撃性というよりは悲しみでありその悲しみを分かってほしいという思い
参照元:家庭内暴力、止める方法あります 精神科医の斎藤環(たまき)筑波大教授 2019年6月20日 5時30分 朝日新聞DIGITAL
ひきこもり、家庭内暴力、自分を情けないと思う人を解説 / Explaining people who think they are pathetic
ビタミンは13種類あり、9つは水溶性、4つが脂溶性です。脂溶性ビタミンのうちの一つがビタミンAです。化合物の名称は、レチノール。名前が示すように網膜(レチナ)に関係し、オールという語尾からわかるようにアルコールつまり水酸基(-OH)を持っています。
レチノール(ビタミンA)が酸化されるとレチナールになります。水酸基ーOHがアルデヒドーCHOになった形です。レチナールのアルデヒドがさらに酸化されてカルボキシ基になったものがレチノイン酸です。レチノール、レチナール、レチノイン酸は合わせてレチノイドという総称でも呼ばれます。
ニンジンなどの野菜にふくまれるβカロチンはレチノイドが2つ合わさった形をしており、プロビタミンAと呼ばれます。プロは前という意味なので、ビタミンAの前段階の化合物という意味です。ビタミンAを食事から摂取する方法に関していえば、動物性食品からビタミンAを直接接種するだけでなく、野菜などからβカロチンを摂取してもいいというわけです。βカロチンは体内で半分に分解されてビタミンAとして働きます。
ビタミンAの生体内の働き方は大きく分けると2つあります。一つは視細胞において、光を受容する働きです。私たちが物を見ることができているのは、ビタミンA誘導体レチナールが光を吸収しているのからです。二重結合の両側がトランスの配向かシスかということですが、光を受容するとトランスが11-シスになります。炭素の番号のつけ方は、6員環のメチル基が2つついた炭素が1番で、反時計回りに2,3,4,5,6、枝のほうに出て、7,8,9,10,11,12,13,14、15です。メチル基の枝は無視して、主鎖に最初に番号を振っていきます。上の図で11番と12番の間の二重結合に関してシスに変化しています。
もう一つの働き方は、細胞を分化させるなどの細胞の運命を調節する働きです。
ビタミンAの構造式をどうやって覚えるかですが、6員環から枝が伸びていて二重結合が全部に入ると思えばいいでしょう。主鎖の炭素が15番までと覚えて、あとは視覚的にメチル基の枝の場所を覚えられるのではないかと思います。
ビタミンAの働きは何かというと、ひとつはレチナ(網膜)で光を感じるのに必要です。私たちは普段、目でものをみていますが、これは外界から入ってきた光を捕獲しているということにほかなりません。光を捕獲する物質こそがレチナールなのです。光を受け取る前はシス型になっていますが、光を受け取るとオールトランス型に変わります。レチナールはオプシンというタンパク質に結合しており(レチナールが結合した桿体細胞のオプシンをロドプシンと呼ぶ)、レチナールが光を受容して形がかわったことで視細胞の膜状にあるロドプシンは細胞内へシグナルを伝えます。視細胞は、この変化を電気的な活動に変換します(過分極応答)。これが私たちがものを見えているときに起きている現象なのです。錐体細胞も同様で、オプシンに11-シスレチナールが結合しています。錐体のオプシンは3種類あり赤、緑、青の色覚を受け持っています。ロドプシンは色は感じません。同じレチナールが同じようにオプシンに結合しているのになぜ違う色が見えるのかはかなり不思議なことですが、それぞれのオプシンの違いがレチナールの周囲の環境の違いとなって、吸収される波長が変わるのだそうです。
Though all of these opsins bind the same 11-cis-retinal chromophore, their absorption properties are uniquely modulated by the protein environment and its coordinated water molecules of each of the opsins to produce the set of pigments that enable color vision [16, 17]. (The photochemical determinants of color vision Bioessays. 2014 Jan; 36(1): 65–74.)
The dominant physical mechanism responsible for the opsin shift in color vision is the interaction of dipolar amino acid residues with the ground- and excited-state charge distributions of the chromophore.(How color visual pigments are tuned Gerd G. Kochendoerfer, Steven W. Lin, Thomas P. Sakmar, Richard A. Mathies Volume 24, Issue 8, 1 August 1999, Pages 300-305 Journal home page for Trends in Biochemical Sciences Review )
目で光を感じるときにレチナール(ビタミンAの誘導体)が必要なことから、ビタミンAが欠乏すると光を受容する感度が下がってしまい、暗い場所や光が少ない夜間にはものがみえない夜盲症という病気になります。しかし、ビタミンAの重要性は、視覚での働きだけではありません。胚の発生にも重要な働きがあります。レチノイン酸には催奇性があり、妊婦がビタミンAを過剰に摂取すると、奇形児になる恐れがあります。多すぎもダメなんですね。
レチノイン酸はまた、皮膚の細胞を分化させ角質のタンパク質であるケラチンを発現させる働きもあります。
When human keratinocytes are grown on their dermal equivalent (fabricated collagen lattices), physiologic concentrations (1–10 nm) of RA result in an epithelium very similar to that in normally keratinized epidermis (Retinoic Acid-Induced Epidermal Transdifferentiation in Skin J. Dev. Biol. 2014, 2(3), 158-173; https://doi.org/10.3390/jdb2030158)
ビタミンAは生体内で多彩な働きをしていることからビタミンAに関連した薬物を治療薬として使うという戦略があります。
iPS細胞を再生医療の分野に応用する試みとして、眼科領域ではiPS細胞由来の角膜上皮移植が試みられているそうです。
HLA遺伝子は第六染色体短腕部分にあり、クラス1に所属するA、B、C遺伝子、クラスⅡに所属するDP、DQ、DR遺伝子がある。まとまった【クラスⅠ(A-B-C)-クラスⅡ(DP-DQ-DR)】をハプロタイプという。A、B、C遺伝子、DP、DQ、DR遺伝子は、例えばA座について、A1、A2、A3……と数十種類の型(アリル)があり、それは、B、C遺伝子、DP、DQ、DR遺伝子も同様にそれぞれ数十種類の異なるアリルがある。そのためハプロタイプの組み合わせは、数万通りの多様性を生む。父方から一つハプロタイプ、母方の1つのタイプのハプロタイプを持ち、計2つのハプロタイプが一対になって一つのセットを形成する。両親それぞれから同じアリルを受け継いだ場合、例えばA座について、A1A1、A2A2、A3A3……のような組み合わせの細胞を「HLAホモ接合体」と言い、「HLAヘテロ接合体」の人に移植しても免疫拒絶反応が起こりにくいと考えられている。(ゲノム編集による HLA遺伝子改変がiPS再生医療の鍵か? 2020.03.27 セツロテック)
ハプロタイプは理解できたとして、遺伝子A、B、Cや遺伝子DP、DQ、DRからできるポリペプチドによってできるMHCクラスI分子やMHCクラスII分子はどのような構造をしているのでしょうか。
MHCクラスI分子は、45kDaの大きさのペプチド鎖と12kDaの大きさのペプチド鎖(β2ミクログロビン)からなる二量体です。クラスI遺伝子A、B、Cは45kDaのペプチドをコードしており、ハプロタイプの説明にあるように遺伝子が3種類、さらにそれぞれの遺伝子で数十種類のアレルがあります。その一方で、β2ミクログロビンは、別の染色体上にあり、遺伝子A,B,Cからできるペプチド鎖に共通して用いられます。
つまり一つの細胞の中では、父親由来の染色体6番と母親由来の6番染色体のそれぞれにMHCクラスI遺伝子A,B,Cがあるので、合計6種類のMHCクラス1分子の45kDaペプチドが存在することになります。
クラスIIMHC分子は、ほぼ同じ大きさと形をもつα鎖とβ鎖からなる二量体です。遺伝子DP,DQ,DRのそれぞれがα鎖とβ鎖をコードする遺伝子を持っています。またα鎖とβ鎖の組み合わせは、DP内、DQ内、DR内だけであって、DPのα鎖とDQのβ鎖といった組み合わせはありません。ただし、父親由来の6番染色体と母親由来の6番染色体があるわけですが、αが父親由来のDPから、βは母親由来のDPからという組み合わせは許されています。
ということは、アレルが全部異なっている場合には、2x2x3=12通りのMHCクラスII分子が一つの細胞内で発現していることになりますかね。
ちなみに兄弟でどれくらいHLAが一致する可能性があるかというと、父親からどちらの6番染色体をもらうかで2通り、母親から母親がもっている6番染色体のどちらをもらうかで2通りあるので、組み合わせは2x2=4通りになります。
ハプロタイプの実際のデータが下のリンクから得られます。
疾患 | 関連を示すHLA型 | 患者集団中の 頻度(%) |
一般集団中の 頻度(%) |
オッズ比 | |
強直性脊椎炎 | HLA-B27 | 83.3 | 0.5 | 1056.3 | |
ベーチェット病 | HLA-B51 | B*51:01 | 59.4 | 13.6 | 9.3 |
ナルコレプシー
|
HLA-DR2 | DRB1*15:01 | 100 | 12.4 | 1372.7 |
HLA-DQ6 | DQB1*06:02 | 100 | 12.4 | 1372.7 | |
関節リウマチ
|
HLA-DR4 | DRB1*04:05 | 58.8 | 24.7 | 4.4 |
HLA-DQ4 | DQB1*04:01 | 58.8 | 24.7 | 4.4 | |
1型糖尿病
|
HLA-B54 | B*54:01 | 44.1 | 14 | 4.8 |
HLA-DR4 | DRB1*04:05 | 56.6 | 24.7 | 4 | |
多発性硬化症 (眼神経、脊髄型) |
HLA-DPw5 | DPB1*05:01 | 93.6 | 61.8 | 9 |
初学者が免疫学の教科書を読んでいて感じる一番のフラストレーションは、結局病原体の侵入に対してどんな免疫応答が起こるのかが、順を追って説明されていないということなのではないでしょうか。一番知りたいことが、書いていないのです。しかもたとえ免疫学の教科書を一冊読み終えてもいまひとつよくわからないという読後感が残ってしまいます。
病原体の侵入から始まって、免疫系のどんな細胞が何をするのか、どうやって病原体を撃退するのかをストーリーを追って説明している教科書は少ないながらもいくつかあります。ブルーバックスの『新しい免疫入門』が自分は一番わかりやすいと思いました。ただし、免疫系の細胞はたくさんの種類があり、それらの細胞が起こす反応も多岐にわたっており、また病原体の種類(細菌か、ウイルスか、寄生虫か)によってもストーリーが異なるため、なかなか全体像をつかむのは容易ではありません。自然免疫、獲得免疫の細胞性免疫と液性免疫、それらの相互作用と、ストーリーは途中で枝分かれしたりまた枝がつながったりして、本当にドラマチックだと思います。
こうした複雑なストーリーを理解するには、説明された文章を追って自分で絵をかいてみることでしょう。もしくは、そのように描かれた画を眺めてみることです。また小説の冒頭に登場人物の説明があったりしますが、あらかじめ登場人物の簡潔な紹介を読んでおくのも助けになります。
マクロファージ:食細胞の一種で、自然免疫に属する細胞。異物を食べて処理する。
下の動画は、マクロファージが細菌をガンガン食べていく様子を示しています。
Bacterial phagocytosis by macrophage -マクロファージによる細菌の貪食- TIMELAPSE VISION
食べたものを分解してペプチドを抗原提示することもできる。ただし抗原提示能は、プロフェッショナル抗原提示細胞である樹状細胞には劣る。
好中球:白血球の数で過半数を占める細胞。食細胞であり、細菌などを食べて処理する能力が高い。自然免疫に属する。
Phagocytosis of MRSA by a human neutrophil NIAID チャンネル
Crawling Neutrophil Chasing a Bacterium YouTube·Andres Trevino·2006/05/21
中性色素で細胞がよく染色されることからこの名がある。
樹状細胞:食細胞の一種で、自然免疫に属するが、自然免疫と獲得免疫とを結びつける非常に重要な役回りを果たしている。活性化すると文字通り樹状の形状になる。
Dendritic cell -樹状細胞- TIMELAPSE VISION タイムラプスビ
病原体などを食べて、病原体由来のタンパク質を分解したペプチドをMHCクラスI分子の上に載せてナイーブキラーT細胞に提示したり、MHCクラスII分子の上に載せてナイーブヘルパーT細胞に提示したりすることができる。
T細胞とB細胞:多様な抗原に対する特異的な抗原受容体をもった細胞として、T細胞とB細胞とがある。T細胞はT細胞抗原受容体(TCR)を表面に発現している。B細胞はB細胞抗原受容体(BCR)を表面に発現している。B細胞は活性化すると、形質細胞(プラズマ細胞)に変化し、BCRを発現するのをやめるかわりに、BCRと同じ抗原特異性を持つ抗体(免疫グロブリン)を産生するようになる。抗体にはIgA,IgG,IgD,IgE,IgMの5種類(アイソタイプと呼ばれる)が存在し、膜結合型もしくは分泌型(水溶性)である。T細胞はキラーT細胞とヘルパーT細胞の種類に分かれる。
ナイーブキラーT細胞:別名CD8細胞。細胞表面のマーカー分子としてCD8を発現している。またT細胞抗原受容体(TCR)を表面膜状に発現している。TCRは、遺伝子再編成により構築されるため一つ一つの細胞が異なる抗原を認識することができる。MHCクラスI分子上に提示されたペプチド抗原を認識する際に、CD8は相手の細胞のMHCクラスI分子と結合することにより、細胞同士の結合を安定化する働きがある。抗原提示細胞との相互作用により、「活性化」して増殖し、抗原特異的に相手を殺傷することができるため、キラーT細胞の名がある。ナイーブの意味は、まだ抗原と出会っていないという意味であり、抗原と出会って活性化されると、活性化キラーT細胞になる。
ナイーブヘルパーT細胞:別名CD4細胞。細胞表面のマーカー分子としてCD4を発現している。またT細胞抗原受容体(TCR)を表面膜状に発現している。TCRは、遺伝子再編成により構築されるため一つ一つの細胞が異なる抗原を認識することができる。MHCクラスII分子上に提示されたペプチド抗原を認識する際に、CD4は相手の細胞のMHCクラスII分子と結合することにより、細胞同士の結合を安定化する働きがある。抗原提示細胞との相互作用により、「活性化」して増殖し、抗原特異的にB細胞やキラーT細胞の活性化をヘルプすることができるため、ヘルパーT細胞の名がある。Th細胞とも呼ばれる。まだ抗原と出会っていない細胞がナイーブヘルパーT細胞で、抗原との反応により活性化された場合は、活性化ヘルパーT細胞と呼ばれる。ヘルパーT細胞にはTh1、Th2、Th17などの種類がある。
免疫学の教科書を読んでいたら免疫グロブリンの構造のところでY字型をしているその先の2つ部分(可変領域)は、2つ形が同一という説明があって、あれ?と思いました。細胞は父親由来と母親由来の染色体をそれぞれもっているので、もし抗体の多様性をつくるための遺伝子組み換えがそれぞれで勝手に起きていたら、一つの細胞内に2種類の可変領域を持つ遺伝子ができてしまって混じってしまわないの?という疑問です。
実際のところ、そのように2種類の可変領域ができることはないのですが、なぜそうなるのかというとallelic exclution(対立遺伝子排除)という現象が起きているからでした。つまり対立遺伝子の片方はサイレントな状態にされているのです。勉強すればするほど、生き物は巧妙にできているなあと感心させられます。