疑問：転写因子Eomesは、Eカドヘリンをダウンレギュレーションさせるが、タイトジャンクションの要素であるZO-1も同様に発現が落ちるのか？

Consensus:

EomesによるEカドヘリンのダウンレギュレーション時、ZO-1も同様に発現が低下する可能性が高いです

EMT（上皮間葉転換）におけるEカドヘリンとZO-1の発現変化

• EMTが進行すると、Eカドヘリン（CDH1）とタイトジャンクション構成因子ZO-1（TJP1）はともに発現が低下することが多くの研究で示されています (Chen et al., 2016; Wanna-Udom et al., 2024)。
• 例えば、HMGB1によるEMT誘導実験では、EカドヘリンとZO-1の両方がmRNA・タンパク質レベルで同時にダウンレギュレーションされることが確認されています (Chen et al., 2016)。
• EMTを抑制する因子（ARID1Aなど）を過剰発現させると、EカドヘリンとZO-1の発現がともに上昇し、細胞の移動能が低下します (Wanna-Udom et al., 2024)。

Eomesの役割と推察

• Eomesは中胚葉誘導やEMT促進に関与し、Eカドヘリンの発現抑制を通じて細胞接着性を低下させます。
• EMTの分子マーカーとしてEカドヘリンとZO-1の同時低下が広く観察されているため、EomesによるEカドヘリンのダウンレギュレーション時には、ZO-1も同様に発現が落ちる可能性が高いと考えられます (Wanna-Udom et al., 2024; Chen et al., 2016; Zeisel et al., 2018)。

EMTにおける主要マーカーの変化

Figure 1: EMT時のEカドヘリン・ZO-1・ビメンチンの発現変化

結論

EomesがEカドヘリンをダウンレギュレーションする状況では、ZO-1も同様に発現が低下する可能性が高いです。これはEMTの一般的な分子メカニズムに基づくものであり、多くの細胞種や発生段階で共通して観察されています。

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References

Wanna-Udom, S., Aluksanasuwan, S., Somsuan, K., Mongkolwat, W., & Sakulsak, N. (2024). ARID1A overexpression inhibits colorectal cancer cell migration through the regulation of epithelial‑mesenchymal transition. Molecular Medicine Reports, 30. https://doi.org/10.3892/mmr.2024.13325

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Zeisel, M., Dhawan, P., & Baumert, T. (2018). Tight junction proteins in gastrointestinal and liver disease. Gut, 68, 547 – 561. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2018-316906

似た名前の物質が同時に出てくると非常に紛らわしいですが、LEF1とLefty1は別物です。

Excellent question — and it’s a very common source of confusion because LEF1 and Lefty1 sound deceptively similar but are completely different genes.

🧬 LEF1 (Lymphoid Enhancer-binding Factor 1)

• Full name: Lymphoid Enhancer Factor 1
• Family: Member of the LEF/TCF transcription factor family
  (includes LEF1, TCF7 (TCF-1), TCF7L1 (TCF-3), TCF7L2 (TCF-4))
• Pathway: Canonical Wnt/β-catenin signaling
  • LEF1 binds DNA at Wnt-responsive elements.
  • When Wnt signaling is active, β-catenin binds LEF1 → co-activates target genes (e.g., Axin2, Cyclin D1, Myc).
• Role in development: Cell fate specification, axis formation, hair follicle and hematopoietic development.
• Type: Transcription factor

🧫 Lefty1 (Left–Right Determination Factor 1)

• Full name: Left-Right Determination Factor 1
• Family: Member of the TGF-β superfamily, closely related to Nodal antagonists (Lefty1, Lefty2, Cerberus).
• Pathway: Nodal/Activin signaling
  • Lefty1 is a secreted protein that antagonizes Nodal by binding either Nodal itself or its co-receptors.
• Role in development: Establishing left–right asymmetry, controlling the spread of Nodal activity during gastrulation.
• Type: Secreted morphogen (signaling inhibitor)

✅ In summary

So:

LEF1 belongs to the LEF/TCF transcription factor family, not to Lefty1.
They are unrelated in both function and pathway — one is a nuclear transcription factor, the other is a secreted signaling molecule.

発生学の勉強をしていて、nodalの標的遺伝子の中にはnodalが含まれるという記述をみかけたのですが、nodalと協調してはたらくwnt3もやはりnodalの標的遺伝子の一つになっているのでしょうか？

その答えは、この論文のグラフィカルアブストラクトにはっきりと描かれていました。https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1934590916303423

NodalはWnt3遺伝子の転写を活性化します。Wnt3は細胞外に分泌され、自身がそれをうけとりβカテニンを介してnodalシグナル経路のSmadと協働してEomesなどの中内胚葉（mesendoderm）の分化に必須の遺伝子を活性化します。

以下、Consensusによるまとめ：

NODALシグナルはWnt3遺伝子発現を活性化する：発生生物学における分子ネットワークの解明

NODALシグナル伝達は、胚発生や細胞分化の制御において中心的な役割を果たします。近年の研究により、NODAL/ActivinシグナルがWnt3遺伝子の発現を直接誘導し、その後のWNT経路活性化を通じて発生プログラムを制御する分子メカニズムが明らかになってきました。

NODALシグナルによるWnt3発現の直接誘導

NODAL/ActivinシグナルのエフェクターであるSMAD2は、Wnt3遺伝子のエンハンサー領域に結合し、クロマチンの開放とともにWnt3の発現を迅速に誘導します。特に、SMAD2と転写因子ZIC3の協調作用により、NODAL/Activin刺激後1時間以内にWnt3の発現が開始されることが示されています (Coda et al., 2022)。

Wnt3の役割とNODALシグナルとの協調

誘導されたWNT3は、WNT/β-カテニン経路を活性化し、遅延型NODAL/Activin標的遺伝子（EomesやTなど）の発現に必須です。Wnt3のノックダウン実験では、これら遅延標的遺伝子の発現が著しく低下することが確認されており、NODALとWNT経路の協調的な作用が発生運命決定に不可欠であることが示唆されています (Coda et al., 2022; Wang et al., 2017)。

発生分化における統合的ネットワーク

p53ファミリーもWnt3の発現制御に関与し、NODAL-SMAD2/3とWNT-TCF3の転写因子が協調して分化遺伝子のエンハンサーに結合します。Wnt3の発現開始は、胚発生の重要なタイミングと一致し、NODALとWNT経路の相互依存的な活性化が胚葉分化を駆動します (Wang et al., 2017)。

Wnt3発現制御の分子メカニズム

Summary

NODALシグナルはSMAD2やZIC3などの転写因子を介してWnt3遺伝子発現を直接活性化し、WNT3はNODAL経路と協調して発生分化の遺伝子発現プログラムを制御します。これらの経路の統合的な作用は、胚発生や細胞運命決定に不可欠であることが明らかになっています。

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References

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NodalとActivinは「同じ」受容体を使うが、完全に同一ではありません

受容体の共通性と違い

NodalとActivinはどちらもTGF-βスーパーファミリーに属し、シグナル伝達には「アクチビン型I型（ALK4, ALK7）およびII型（ActRIIA, ActRIIB）」セリン/スレオニンキナーゼ受容体を共有します (Reissmann et al., 2001; Tsuchida et al., 2008; Preiß et al., 2022; Lee et al., 2011; Tsuchida et al., 2009; Nadeem et al., 2011; Miles et al., 2013)。

• Activin：主にALK4（ACVR1B）とActRIIA/ActRIIBを利用し、コレセプター（Criptoなど）は不要です (Gray et al., 2003; Lee et al., 2011; Tsuchida et al., 2009)。
• Nodal：ALK4またはALK7とActRIIB（主に）を利用しますが、CriptoなどEGF-CFCファミリーのコレセプターが必須です (Reissmann et al., 2001; Preiß et al., 2022; Gray et al., 2003; Lee et al., 2011; Tsuchida et al., 2009; Nadeem et al., 2011)。

分子機構の違い

• NodalはCriptoなどのコレセプターがなければ受容体複合体を形成できませんが、ActivinはCriptoなしで直接受容体複合体を形成しシグナルを伝達できます (Gray et al., 2003; Lee et al., 2011; Tsuchida et al., 2009)。
• ALK7はNodalに対してより特異的なI型受容体であり、Activinは主にALK4を介して作用しますが、両者ともALK4/ALK7とActRIIA/ActRIIBの組み合わせでシグナルを伝達できます (Reissmann et al., 2001; Tsuchida et al., 2008; Preiß et al., 2022; Tsuchida et al., 2009; Nadeem et al., 2011; Miles et al., 2013)。

受容体利用のまとめ

Figure 1: NodalとActivinの受容体利用の比較表

結論

NodalとActivinは「アクチビン型I型・II型受容体」を共有しますが、Nodalはコレセプター（Cripto等）が必須であり、受容体利用やシグナル伝達の詳細に違いがあります。完全に同一の分子機構ではありませんが、受容体の主要部分は共通です。

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References

Reissmann, E., Jörnvall, H., Blokzijl, A., Andersson, O., Chang, C., Minchiotti, G., Persico, M., Ibáñez, C., & Brivanlou, A. (2001). The orphan receptor ALK7 and the Activin receptor ALK4 mediate signaling by Nodal proteins during vertebrate development.. Genes & development, 15 15, 2010-22. https://doi.org/10.1101/gad.201801

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Preiß, H., Kögler, A., Mörsdorf, D., Čapek, D., Soh, G., Rogers, K., Morales-Navarrete, H., Almuedo-Castillo, M., & Müller, P. (2022). Regulation of Nodal signaling propagation by receptor interactions and positive feedback. eLife, 11. https://doi.org/10.7554/elife.66397

Gray, P., Harrison, C., & Vale, W. (2003). Cripto forms a complex with activin and type II activin receptors and can block activin signaling. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 100, 5193 – 5198. https://doi.org/10.1073/pnas.0531290100

Lee, K., Lim, S., Orlov, Y., Yit, L., Yang, H., Ang, L., Poellinger, L., & Lim, B. (2011). Graded Nodal/Activin Signaling Titrates Conversion of Quantitative Phospho-Smad2 Levels into Qualitative Embryonic Stem Cell Fate Decisions. PLoS Genetics, 7. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002130

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Nadeem, L., Munir, S., Fu, G., Dunk, C., Baczyk, D., Caniggia, I., Lye, S., & Peng, C. (2011). Nodal signals through activin receptor-like kinase 7 to inhibit trophoblast migration and invasion: implication in the pathogenesis of preeclampsia.. The American journal of pathology, 178 3, 1177-89. https://doi.org/10.1016/j.ajpath.2010.11.066

Miles, D., Wakeling, S., Stringer, J., Van Den Bergen, J., Wilhelm, D., Sinclair, A., & Western, P. (2013). Signaling through the TGF Beta-Activin Receptors ALK4/5/7 Regulates Testis Formation and Male Germ Cell Development. PLoS ONE, 8. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054606

(Consensus)

発生学の論文や教科書を読んでいると、中胚葉誘導の主役としてnodalが登場しますが、アフリカツメガエルの実験の記述ではXnr (Xenopus nordal-related)といった表現を目にします。nordal-relatedはnodalにrelatedな別の分子なのでしょうか？それとも同じ分子を指しているのでしょうか？ちょっと混乱させられたので、頭を整理したいと思います。

質問：nodal-related は、nordalとは別物？アフリカツメガエルにはnodal-related遺伝子以外に、別に、nodal遺伝子も存在するの？

Gemini:

発生生物学において、非常に重要な問題の一つに、中胚葉を誘導する物質は何か？というものがありました。多くの生物学者が人生を棒に振る（研究を頑張っても、何も結果が見出せなかったため）くらいに大変難しい問題だったわけですが、突破口となったのはアクチビンの作用の発見でした。

誘導物質がその学会でのメインテーマだったんです。それまではM-ファクターやP-ファクターなどと呼ばれていたものを、僕がいきなりアミノ酸の配列を提示して、アクチビンという具体的なタンパク質名を提示したものだからみんなびっくりしましたね。‥　その頃アメリカではアメリカ国立衛生研究所（NIH）が多額の研究費を使って誘導物質を探していましたし、イギリスは国家プロジェクトとして誘導物質の探索を進めていたからだったのです。‥60年以上ずっと混乱していた誘導物質の研究が、アクチビンという1つの物質に集約したのです。（変わらない熱情で、中胚葉へと変わる過程を見る Asashima Makoto 浅島 誠　JT生命誌博物館　https://brh.co.jp/s_library/interview/76/）

アクチビンの発見者は日本人の浅島誠博士で、アクチビンの中胚葉誘導作用は日本の高校の生物の教科書にも紹介されています。

アクチビンという物質には、両生類の中胚葉誘導とよく似た現象を引き起こす作用が認められている。‥　アクチビンが、アニマルキャップの細胞に働きかけ、中胚葉の組織や器官を形成するための遺伝子を発現させたと考えられる。（啓林館　平成２９年度用　高等学校理科用　生物　本川達雄　谷本英一　編）

中胚葉の誘導を起こす物質の1つにアクチビンと呼ばれるタンパク質がある。‥　このようにアクチビンは、その濃度に応じてさまざまな中胚葉性の組織や器官を誘導する。（チャート式シリーズ　新生物　生物基礎・生物　数研出版　新課程版平成25年2月1日）

上の2つの記述を比較すると、教科書のほうが参考書よりも注意深く書かれていることがわかります。教科書のほうは、アクチビンは生体内で働く物質ではないことを暗に示すような書きかたに工夫されているのです。参考書のほうでは、その配慮が薄まっており、学習者は、アクチビン＝中胚葉誘導物質（生体内で働く）と理解（誤解）してしまうでしょう。

ChatGPT 5：

高校生物で教えられる「アクチビン（Activin）は中胚葉誘導因子として働く」という説明は、発生学的に正しい内容に基づいています。ただし、その背景を少し深掘りすると理解がより正確になります。

🧬 1. アクチビンとは

• アクチビン（Activin）は TGFβスーパーファミリーに属する分泌性タンパク質です。
• もともとは哺乳類の下垂体ホルモン調節因子（FSHの分泌促進）として発見されましたが、
  後に発生初期胚での中胚葉誘導因子であることが分かりました。
• 分子構造的には、ノーダル（Nodal）やBMPなどと近縁です。

🌱 2. 中胚葉誘導因子としての役割

• アフリカツメガエル（Xenopus laevis）やニワトリなどの実験で、
  動物極側（将来外胚葉になる部分）の細胞にアクチビンを与えると、
  筋肉・脊索・腎臓など中胚葉性組織に分化することが確認されました。
• これが「アクチビン＝中胚葉誘導因子」と呼ばれる根拠です。

⚙️ 3. 分子機構（TGFβ/Smad経路）

• アクチビンは細胞膜上の Activin受容体（タイプII型・タイプI型） に結合します。
• その結果、Smad2/3 → Smad4 の経路が活性化し、
  Eomes, Mixl1, Brachyury (T) などの中胚葉・内胚葉関連転写因子を誘導します。
• この経路は Nodalシグナル とほぼ共通しており、
  実際、哺乳類では「中胚葉誘導の主因子」は Nodal とされています。
  ただし、実験的モデルではアクチビンが代用できるため、
  教科書では便宜的に「アクチビンが中胚葉を誘導する」と説明されています。

🧭 4. まとめ

🔹簡潔に言うと：

高校教科書の「アクチビン＝中胚葉誘導因子」は正しい。ただし、現在の理解では「アクチビンは Nodal/Activin系 シグナルの一部であり、発生初期において中胚葉・内胚葉を誘導する代表的な因子のモデルとして用いられる」と表現するのがより正確です。

以上、ChatGPT5の解説でした。

高校生物の教科書に書かれているアクチビンに関する記述は非常に正確であり、書かれている内容に関しては何の問題もないのですが、読んだ人は、アクチビン＝中胚葉誘導物質と理解するのが普通ではないでしょうか。ところが、「アクチビン＝中胚葉誘導能を持つ物質」ではありますが、「アクチビン＝生体内で中胚葉を誘導する役割を担っている物質」ではありません。このような区別は、初学者には困難でしょうから、「アクチビン＝中胚葉誘導物質」と理解して覚えてしまうのではないかと思います。

そんなわけで、自分は、高校の生物の教科書の記載はもっと事実をわかりやすく書いたほうがよいのではないかと思います。この点をさらに深く掘るために、質問をかなり具体的にしたうえで、生成AIに説明させてみましょう。

質問：日本の高校の教科書には、「アクチビン＝中胚葉誘導因子」という記述がありますが、これは誤解を招きやすい説明ではないでしょうか。ある因子が発生に必要か十分かは、添加実験や過剰発現の実験で十分性を示し、ノックアウトやノックダウンにより必要性を示して、さらに、しかるべき時期にしかるべき場所で正常発現していることまで確認して、この３つがセットで揃ったときに初めて、この因子はこれこれの発生の過程で働いていると結論づけられます。アクチビンは十分条件を満たしたに過ぎません。発生学の研究者が納得するきちんとした説明、すなわち、現在におけるアクチビンの中胚葉における役割の見直しについて説明ください。

Geminiの回答：

高校生向けの記述をするとしたら、以下のようになろうかと思います。Geminiに作文してもらいました。ここでいう「鍵穴」とは、受容体のことです。鍵は、アクチビンやノーダルということになります

mesoderm中胚葉や、endoderm内胚葉という言葉は、発生学を勉強するとお馴染みの用語になります。しかし、発生学を少し細かく勉強していると、mesendodermという言葉に出くわします。これは一体何でしょうか？

mesendodermは、中胚葉と内胚葉を併せたものではありません。特定の組織を指す言葉でもありません。mesendodermを理解するためには、哺乳類の発生は両生類の発生とはことなり、中胚葉も内胚葉も外胚葉から分化するということを押さえておく必要があります。つまりもともと外胚葉の細胞だったものが、細胞シグナルの影響により中胚葉または内胚葉に分化できる状態になったおきにその細胞の状態のことをmesendodermと呼ぶのです。肺の一部の組織を指し示して、ハイ、この部分がmesendodrmですよと呼べるわけではないのです。

mesendoderm（メゼンドダーム）とは？

• 定義（機能的）
  原始線条/原口周辺でNodal/Activin系シグナルにより誘導され、**中胚葉（mesoderm）と内胚葉（endoderm）のいずれにも分化し得る“前駆細胞集団”**を指します。まだ最終運命が固定していない段階の「中＋内胚葉の共通祖先」です。
  ⇒ 胚葉そのものの名前ではなく，“発生段階での運命潜在性”を表す用語。
• なぜこの言い方をするのか（用語の必要性）
  胚の初期（陥入/ingression直後）には、中胚葉と内胚葉を分ける前の共通誘導・共通転写ネットワークが働く時期があり、形態学的にも分子的にも両者が未分化で連続しているから。
  研究上、
  1. 共通の誘導信号（高〜中強度のNodal/Smad2/3）、
  2. 共通の転写因子ネットワーク（Eomes, Foxa2, Mixl1 など）、
  3. 共通の位置（原始線条/オーガナイザー周辺）
     をまとめて扱う必要があるため、「mesendoderm」という操作的・発生学的カテゴリーが便利です。
• 実務的な使い分け
  • mesendoderm：まだ中/内の両方へ行ける前駆段階。
  • definitive endoderm（最終内胚葉）：Sox17, Foxa2高発現などで内胚葉としてコミットした後。
  • mesoderm（中胚葉）：T(Brachyury), Mesp1 などで中胚葉へコミットした後。
  • 除外：外胚葉は含まない。**栄養内胚葉（ビテリン/卵黄嚢由来のextraembryonic endoderm）**も通常は含まない。
• シグナル強度と運命のざっくり対応（古典的モデル）
  • 高いNodal/Activin → 内胚葉（Sox17, Foxa2）
  • 中等度Nodal + Wnt/Fgf → 中胚葉（T/Brachyury, Mesp1）
  • その境界・前段階がmesendoderm。
• 種をまたぐ概念
  ゼブラフィッシュ・アフリカツメガエル・ニワトリ・マウス・ヒトで観察される普遍的な発生“段階”の概念。名称やマーカーは種で少し違いますが、「中/内の共通前駆」という中身は同じ。
• よくある誤解
  • 「中胚葉＋内胚葉の混ざり」ではなく、分かれる前の共通母集団。
  • 厳密な組織学名というより、運命決定のタイミングを切り取った研究用語です。
  • 「軸性mesendoderm（axial mesendoderm）」という言い方は、前脊索板（prechordal plate）や脊索内胚葉のような“軸沿いの中/内胚葉由来組織”を指す解剖学的サブセットで、文脈により意味が狭くなります。

(ChatGPT 5)

生成AIサービスがたくさん出てきていて、網羅しきれないくらいです。細かいことは別の記事に譲るとして、一覧を作っておきます。

生成AIの有料版サブスクリプションは、科研費での支出も認められているようです。しかしChatGPTなどは毎月のサブスクリプションの場合、「検収」もその期間内に行う必要があります。うっかりわすれて1か月過ぎてしまうと、折角科研費で払えたはずのものが払えなくなってしまうので、要注意です。😿😿😿

1. ChatGPT (OpenAI)：汎用。
2. Gemini (Google)：文字起こしをしてくれる貴重なAI。しかも、かなり正確。Google AI Studio
3. Claude：汎用。
4. DeepSeek：汎用。
5. Grok：学術的な用途には向かないと思う。感情を乗せた文章を書くのが上手い。
6. Semantic Scholar
7. Consensus
8. Perplexity
9. Elicit
10. Notebook LM
11. PaperPal
12. SciSpace (https://scispace.com/)：
13. Zotero (https://libguides.nie.edu.sg/)：研究者向けの文献管理無料ツール
14. BioRender (https://www.biorender.com/)：バイオ研究者向け論文の図（セルシグナリングなどの模式図）作成支援。有料。
15. Connected Papers
16. Scite
17. Scholarcy（https://library.scholarcy.com/）
18. Grammerly (https://app.grammarly.com/)：英文作成支援ツール。
19. Gamma AI
20. Felo (https://felo.ai/)：
21. Manus
22. GenSpark
23. Med-e-gen

論文をどうやって整理するかは、人それぞれ。とくに決まりもないし、学校で習うことでもないので研究者はみな自己流でやっているようです。すると、一度覚えたやり方を変えることなく何十年もその方法で管理していて、実はもっと便利な方法があっても気付かないままということも起こります。

年、頁、タイトルなどの文献情報の記録、論文PDF（本文）の保管、論文執筆時の引用という３つのタスクをどう解決するか、そのためにはどの文献ソフトが一番使いやすいのでしょうか。

ちなみに自分はEndnoteを長年使ってきました。論文はマイクロソフトのワードで書き、Endnoteライブラリーから引用したい文献を選んでワードの文書内に挿入します。当然ですが、その論文のワードファイルと、引用に用いたEndNoteライブラリーはセットにしておく必要があります。えんｄNoteライブラリーのファイルが破損して使えなくなってしまうと論文執筆中の場合、大打撃です。

本文PDFをどうやって整理するかも悩ましい問題です。EndnoteにはPDFを管理する機能もありますが、それを利用するとEndnoteを使ってでしかそのPDFにアクセスできないということになります。なぜならEndnoteはそのファイル名を人間が理解できない機械的なものにしてしまうためです。

自分はPDFファイルに自分で（他のソフトを使わずに）探したり開いたりしたいので、「文献」フォルダに全ての論文PDFを入れてありますどう整理するかはいろいろあり得ますが、雑誌ごとにフォルダを用意して「nature」フォルダ、「Journal of Cell Biology」フォルダなどにその雑誌に掲載された論文のPDFをいれてあります。その際、ファイル名は年号_筆頭著者_最終著者_論文タイトルにしています。最終著者をみれば、どのラボの仕事かがわかります。論文タイトルが長いとファイル名もかなり長くなるので、その場合は途中までで止めるか、内容が一番わかる部分だけにすることもあります。論文タイトルにコロンが使われているときには、コロンを別の記号に代替したり、コロンの前の部分もしくは後ろの部分だけをファイル名に使ったりしています。

「えーっと、あの論文」と思い起こすときには大抵、どの雑誌に掲載されたどこのラボから出た論文という覚え方をしているので、自分が論文PDFを引っ張り出したいときには、このやり方でだいたい上手くいっています。もちろんEndNoteで管理していても、欲しいPDFを引っ張り出すことは簡単なはずですが、やはりEndNoteに依存していることが気持ち悪いのでやっていません。EndNoteは効果なので、自分の研究費が途切れてしまったときにEndNoteが使えなくなる恐れがあり、その時には全ての論文が未整理の状態となるのが恐ろしいからです。

EndNoteライブラリーは、研究テーマごとにつくる？1つに全てを入れる？

ライブラリーは、以前は研究テーマごとにつくっていたことがありましたが、そうすると研究テーマがオーバーラップした場合にどちらに入れるのかという問題が生じるので、自分はライブラリーのファイルは一つだけにして、それにありとあらゆるジャンルの論文を放り込んでいます。自分の研究の専門分野の論文であろうが、ちょっと気になった専門外の論文であろうが、同じライブラリーに入れています。じつのところ、研究が進展したら、無関係だと思っていた研究テーマが重なりを生じる可能性だってありますので、分けるのは得策ではなかろうというわけです。

ではどうやって、論文を分類するかというと、EndNoteのGroupという機能を使っています。Groupによる分類のいいところは、複数のGroupに帰属させることも可能な点です。多分できたはず。

まあ生成AIがいろいろ出てきて、文献の整理もその波に洗われて、EndNoteよりもはるかに作業が効率的になるツールが出てくる（すでに出てきている？）と思います。自分が長年やってきたやり方が一番楽なので、乗り換えるためには、新しい方法が相当楽でないといけないのですが、どうなることでしょうか。