まず単変量で回帰分析を行ってから次に多変量の回帰分析をすることの是非

多変量回帰分析(重回帰分析)で悩ましい問題について。何かの現象を引き起こす要因を同定するために、候補となる要因を複数リストアップして、多変量の回帰分析(重回帰分析)を行い、どの要因が最も寄与が大きいかを調べるということが良く行われます。その際、多変量の回帰分析の前に、個々の要因(独立変数)に関してまず単変量での回帰分析(単回帰分析)を行うという記述を良く見かけます。そのあたりの統計解析の実際的な手順について情報をまとめておきます。

疑問:多変量の前にまず単変量?

多変量解析をするのなら、わざわざ単変量で個別に解析する必要はないのでは?と思ったのですが、同じような疑問を持つ人が多いようです。

ある病気の予後に関して関係があると予想した因子A,B,C,D,E,Fに関して単変量解析をしたら、A,B,Cが有意と考えられた場合、次に多変量解析を行う場合は、A,B,C,D,E,Fのすべての因子で解析して判断すべきでしょうか?それとも関連がありそうなA,B,Cによるモデルで解析するべきでしょうか?(教えて!goo 2009年

上司の発表スライドなどを参考に解析をしております。その中に、単変量解析をしたうえで、そのP値を参考に多変量解析に組み込んで解析しているスライドがあり、そういうものなのかと考えておりました。ただ、ネットで調べますと、それは解析ツールが未発達な時代の方法であり、今は共変量をしぼらず多変量解析に組み込むのが正しいという記述も散見されました。(YAHOO!JAPAN知恵袋2020年)

多変量解析の手順:いきなり多変量はやらない?

多変量解析は、多くの要素の相互関連を分析できますが、最初から多くの要素を一度に分析するわけではありません。下図のように、まずは単変量解析や2変量解析データの特徴を掴んで、それから多変量解析を実施するのが基本です。(多変量解析とは?入門者にも理解しやすい手順や具体的な手法をわかりやすく解説 Udemy 2019年

単変量解析、2変量解析を経て、多変量解析に進みます。多変量解析の結果が思わしくない場合、単変量解析に戻って、再度2変量解析、多変量解析に進むこともあります。(Albert Data Analysis

多変量解析の手順:本当にいきなり多変量はやらないの?

正しい方法は、先行研究の知見や臨床的判断に基づき、被説明変数との関連性が臨床的に示唆される説明変数をできるだけ多く強制投入するやり方です。… 重要な説明変数のデータが入手できない場合、正しいモデルを設定することはできないので、注意が必要です。アウトカムに影響を及ぼしそうな要因に関して、先行研究を含めて予備的な知見がない場合や不足している場合、次善の策として、網羅的に収集されたデータから単変量回帰である程度有意(P<0.10など)な説明変数のみを選択し、多変量回帰分析に強制投入する方法もありです。(第3回 実践!正しい多変量回帰分析 臨床疫学 康永秀生(東京大学) 2018年5月23日 m3.com)

上の説明がしっくり来ました。単変量解析をスキップするのがむしろ正しいようですが、現実的には説明変数の数を絞り込みたいので(サンプル数の数が限られていると、説明変数の数は増やせないので)、単変量解析を事前に行うことはOKとのことのようです。

「なるべく少ない変数:x を投入」が 原則です。  よくある手法としては、まずは単変量解析で独立変数:x 1つ1つの有意差を検定します。  その後、影響があると思われる独立変数:x 数個を多変 量解析に投入します。(医学研究初心者のための やっぱりわかりにくい統計道場 Shingo Hatakeyama 2016)

多変量解析の手順:一番厳格な方法

上の康永秀生氏の説明にもありますが、一番正しい方法は、データを見ずに(=単変量解析をやらずに)いきなり多変量解析を行うことのようです。下のように、新谷歩氏の説明も同様でした。

(6)データを一切見ず,文献や医学的見地を参照し,アウトカムである死亡に対するリスク因子の中からリスクの大きい順に5つ選び出す。

いずれもよく用いられる方法ですが,正解は(6)です。(1)から(5)は,データを用いてP値を一番小さくする方法として知られていますが … 多変量解析における「見過ぎによる出過ぎ」は専門用語では「Overfitting」と呼ばれ,雑誌によっては先ほど示した(1)から(5)の方法を使用しないよう指示している場合もあります2)。(多変量解析―説明変数の選び方(新谷歩)連載2011.10.17 今日から使える医療統計学講座【Lesson6】多変量解析――説明変数の選び方 新谷歩(米国ヴァンダービルト大学准教授・医療統計学))

統計は絶対正しい方法でないとだめということでもないようで、研究領域やジャーナルによって、習慣的にOKとされることがあるようです。

多変量解析の前に単変量解析をやってはいけない

実際にはみなやっているのでOKなのでしょうが、厳格なことを言えば正しくないようです。

The use of bivariable selection (BVS) for selecting variables to be used in multivariable analysis is inappropriate despite its common usage in medical sciences. (Journal of Clinical Epidemiology VOLUME 49, ISSUE 8, P907-916, AUGUST 01, 1996 Inappropriate use of bivariable analysis to screen risk factors for use in multivariable analysis Guo-Wen Sun Thomas L. Shook Gregory L. Kay)

When they say bivariable they mean what you refer to as univariate. (Danger of univariate analysis before multiple regression StackExchange) 1変量解析のことを2変量解析と呼ぶ流儀もあるようです。独立変数1個、従属変数1個を合わせて2変数ということでしょう。

多変量解析の前に単変量解析をやらずにどうするのか

まず単変量解析をやって多変量解析に使う独立変数を決めるというのは、統計学者はNGと言っているにも関わらず、実際の臨床研究の現場では普通に行われているように思います。しかし、ダメなものはダメなのだとしたら、どうすればよいのでしょうか。

重ロジスティック回帰分析や Cox の比例ハザードモデルによる生存時間解析などの多変量回帰分析において,モデルに入れる説明変数を単一因子解析で選定する方法は,誤った解析結果を導く可能性があることを示した.多変量回帰分析では,モデルに入れる変数を逐次変数選択法を含む適切な手法で選ぶことが必要である.

(査読者の立場から見た医学論文における統計解析の留意点 新潟大学医歯学総合病院医療情報部 赤澤 宏平 日本臨床外科学会雑誌 2019 年 11 月 16 日受付 臨床研究の基礎講座 日本臨床外科学会・日本外科学会共催(第 81 回日本臨床外科学会総会開催時)第 23 回臨床研究セミナー)

単変量を最初にやらずとも、逐次変数選択法という方法があるそうです。これで解決かと思いきや、専門家でも異なる考え方があるようです。

 「ステップワイズ法(逐次選択法)」は、統計ソフトが自動的に説明変数を1個ずつ入れたり出したりして、適合度の良いモデルを選択する方法です。この方法は基本的に使わない方がよいでしょう。ステップワイズ法を使うのは、臨床を知らない統計屋がやることです。 正しい方法は、先行研究の知見や臨床的判断に基づき、被説明変数との関連性が臨床的に示唆される説明変数をできるだけ多く強制投入するやり方です。(第3回 実践!正しい多変量回帰分析 臨床疫学 安永英雄(東京大学) 2018年5月23日 m3.com)

悩ましいですね。数学的に正しいこと、統計学的に正しいことであっても、臨床の現場には適用できないということでしょうか。

「まず単変量解析」はダメ、ステップワイズ法もダメ、じゃあどうしろと?

新谷歩先生のウェブサイトの統計学解説記事がとてもわかりやすく(初学者に優しく)好きなので、自分は新谷先生の書いた教科書は全部買いました。ウェブ記事を読むよりも本を読むほうが、自分は落ち着いて勉強ができるので、そういうタイプの人には書籍をお勧めいたします。で、『みんなの医療統計 多変量解析編』に非常にはっきりと、どうすればいいか、何をしてはいけないかが書いてありました。とても重要なことですし、今だに多くの人がまず単変量解析をして有意差が出た変数を多変量に投入すると、当然のように考えているので、ちょっと紹介させていただきます。

やってはいけない例

  1. 単変量解析を行って有意差が出たもののみを多変量回帰モデルに入れる
  2. ステップワイズ法を使って有意差が出た説明変数だけを多変量回帰モデルに入れる
  3. 単変量解析で有意差が出たもののみをステップワイズ法に入れて、最終的に有意差が出たもののみを説明変数として多変量モデルに入れる

参照 216ページ 新谷歩『みんなの医療統計 多変量解析編』

ではどうするのかというと、

何がアウトカムと因果関係をもつかをデータを見ずに、先行文献や医学的観点から考え、アウトカムとの関連性の上で重要なものか選ぶ。臨床的な判断で決める。

参照 215ページ

ということです。

新谷歩『みんなの医療統計 多変量解析編』(アマゾン)初学者に寄り添う優し解説

結局どうすればいいの?

多変量解析の教科書を読んでみても、最初に単変量解析を行っているものを結構見かけます。多変量解析に用いる独立変数の選択方法に関しても、上でやってはいけないこととされていることを当然のように解説している「実践的な統計解析の教科書」のほうがむしろ多数派ではないでしょうか。

科学的に(数学的に)正しいかどうかよりも、自分が所属している研究領域の慣習に従うほうが現実的のような気がします。なぜなら、論文を出すときに査読者がどう考えるかで、自分の論文がリジェクトされるかアクセプトされるかが決まるからです。古い頭の査読者を説得することに失敗して論文が出せなくなっては困ります。あまり無責任なことは言いたくありませんが、自分なら現実的な判断をします。

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  1. editage 研究者向け 英語論文執筆・英語プレゼンテーション セミナー 講師 David Kipler (デビッド・キプラー)氏
  2. 「遺伝研メソッド」科学英語プレゼンテーションの出前研修

医師向けの日本の雑誌

医学のあゆみ

診断と治療

臨床内科

総合診療

月刊 糖尿病

消化器・肝臓内科 科学評論社

消化器外科 へるす出版

2020年8月号 特集 英語論文作成のコツ

臨床眼科

看護実践の科学

生体の科学

実験医学

 

【論文の書き方】医学英語論文執筆のコツ 臨床研究の論文化 臨床論文の書き方のコツ

 

 

要点

  1. 臨床研究論文執筆の原則 森本剛(PDF)

論文の書き方に関する書籍

  1. Story, Not Study: 30 Brief Lessons to Inspire Health Researchers as Writers  Lorelei Lingard , Christopher Watling https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-030-71363-8 邦訳があります。
  2. 英文誌のアクセプトがほしいなら、押さえるべきはココ! 臨床論文の書き方 河井昌彦 2021年03月 金芳堂
  3. 臨床研究と論文作成のコツ―読む・研究する・書く 2011年7月 東京医学社

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消化器外科2020年8月号 特集 英語論文作成のコツ(へるす出版)
1.外科医が英語論文を書く際のハードルと克服法
名古屋大学大学院医学系研究科消化器外科学/神田 光郎
2.外科医が臨床論文を国際誌に投稿する意義
福島県立医科大学低侵襲腫瘍制御学講座/本多 通孝
3.英語論文執筆の指導法
国立がん研究センター中央病院大腸外科/志田 大
4.英語論文作成に必要なポイント
三重大学附属病院ゲノム診療部ゲノム診療科、三重大学大学院医学系研究科消化管・小児外科学講座 奥川 喜永 他
5.reviewerの視点からみた英語論文の書き方と戦略
虎の門病院消化器外科/進藤 潤一
6.効率的な英語論文作成法;抄録を書いたらすぐに論文化!
聖路加国際病院消化器・一般外科/海道 利実
7.英文論文作成の勧め
東京労災病院,杏林大学/杉山 政則
8.消化器外科学英語論文の書き方
東邦大学大学院消化器外科学講座/島田 英昭

【JSGS】消化器外科学論文の書き方 from JSGS on Vimeo.

 

臨床婦人科産科 Vol.74 No.11 今月の臨床 論文作成の戦略 アクセプトを勝ちとるために 医学書院
目次
アクセプトを目指した論文の書き方 濱西 潤三,万代 昌紀
■いまさら聞けない論文作成のキホン
題名・緒言(Title・Introduction)はどう書けば魅力的か? 馬淵 誠士,山中 彰一郎,市川 麻祐子
適切な統計解析の使い方 濱野 鉄太郎
図表作成のポイント 的場 優介,阪埜 浩司,青木 大輔
考察(Discussion)はどう書けば魅力的か? 梶山 広明
投稿するジャーナルの選定と査読の流れ-悪徳雑誌(ハゲタカジャーナル)の見分け方 澤田 健二郎
査読意見に対する回答の仕方 小林 陽一
■論文のまとめ方 : 実践編
症例報告の書き方-意義,症例選定,雑誌選定 高橋 宏典
臨床研究のまとめ方-研究デザインの設定から正しい結果の導き方まで 渡利 英道,金野 陽輔
基礎研究のまとめ方-実験計画の立案から論文作成まで 織田 克利
英文論文にチャレンジしよう! 初めて英文論文を書く人へのアドバイス 矢幡 秀昭,加藤 聖子
Cover letterはどう書けば魅力的か? 田中 良道
英文校正に求めるもの 太田 剛

非劣性試験 (noninferiority trials)

 

非劣性試験 (noninferiority trials)とは

The null hypothesis in non-inferiority trials is that new treatment is inferior to standard treatment. The alternative hypothesis is the new treatment is non-inferior to standard treatment. (Review Non-inferiority trials in cardiology: what clinicians need to know Heart BMJ Journals)

参考

  1. 同等性・非劣性の解析(新谷歩)連載2012.03.26 医学会新聞
  2. Reporting of Noninferiority and Equivalence Randomized Trials Extension of the CONSORT 2010 Statement
  3. Review Non-inferiority trials in cardiology: what clinicians need to know Heart (BMJ Journals) わかりやすい説明。

医学統計データを読む – 医学・医療に必要な統計学活用法 - 第3版

『医学統計データを読む』という医療統計の教科書があります。邦訳は2006年の刊行で今となってはやや古いのですが、題材を全て実際の医学論文からとっているため、統計学を学びたい医師研究者にとってはモチベーションが湧いて良いのではないかと思います。内容を大雑把にですが紹介したいと思います。統計を学ぶためには何かしっかりとした教科書を通読しておくのが良いと思います。
医学統計データを読む – 医学・医療に必要な統計学活用法 - 第3版
刊行年月 2006/5/1この邦訳はBasic & Clinical Biostatistics Fourth edition by Beth Dawson and Robert G. Trappの全訳です。監訳者序文によれば原書には、例題などで扱ったデータや統計ソフトウェアを収めたCD-ROMが付属していますが、この訳書ではそれが省かれています。ちょっと残念ですね。
序文によれば本書の特徴は、実際の医学論文から題材が取られているところです。

臨床研究への序

医学論文では統計学的な手法が妥当ではない論文が大半であるということが紹介されています。例えばWilliamsonらが1992年に報告したものによれば、4235報のうちたったの20%しか妥当とはいえなかったとのこと。

  1. Williamson JW, Goldshmidt PG , Colton T: The quality of medical literature: And analysis of validation assessments. In bailar JC, Mosteller F (editors): Medical uses of Statistics . Massachusetts Medical Society, 1992.
  2. Medical Uses of Statistics 3rd Edition by John C. Bailar and David C. Hoaglin 編集 Wiley 2009 ISBN-13 : 978-0470439524 “Numerous examples based on studies taken directly from the pages of the New England Journal of Medicine
  3. Medical Uses of Statistics 2nd Edition by Bailar and Mostelle. CRC Press 1992 ISBN-13 : 978-0910133364
  4. Medical Uses of Statistics by John C. Bailar III , Frederick Mosteller. New England Journal of Medicine. 1986 ISBN-13 : 978-0910133166

医学研究の研究デザイン

理学の分野の研究であれば、すなわち「実験研究」なわけですが、医学研究においては、「観察研究」と「実験研究」(介入を含む研究のこと)に大きく分けられます。観察研究はさらにいくつかに分類されます。医学で研究を計画する際にも、あるいは、医学研究の論文を読む際にもこういった実験のデザインが何かを理解しておくことが必須になります。

データの要約と表・グラフの提示

オッズ比

題材として取り上げられている論文とデータ

  • R A Ballard 1, P L Ballard, A Cnaan, J Pinto-Martin, D J Davis, J F Padbury, R H Phibbs, J T Parer, M C Hart, F L Mannino, S K Sawai.  Antenatal thyrotropin-releasing hormone to prevent lung disease in preterm infants. North American Thyrotropin-Releasing Hormone Study Group N Engl J Med . 1998 Feb 19;338(8):493-8. doi: 10.1056/NEJM199802193380802.  テーブル2 本文も無料。

データの推論に使用する確率と関連事項

 

1群についての研究課題

 

2つの個別・独立の群についての研究課題

 

3群以上の平均値についての研究課題

 

変数の関係についての研究課題

 

生存率の分析法

 

多変数の統計的手法

 

調査研究

 

エビデンス医療と決定分析の方法

 

医学論文を読む

参考

  1. 医学統計データを読む 第3版 – 医学・医療に必要な統計学活用法 -(メディカル・サイエンス・インターナショナル)医科統計学の好評入門テキスト、初の全訳
  2. 医学統計データを読む(版元ドットコム)目次

position paper (ポジションペーパー)とは?

ポジションペーパー

ポジションペーパーは、ある問題やアイデアに対して、賛成あるいは反対いずれであれ意見を述べるものです。特定の問題(トピック)について議論したり、再考を求めたりするために書かれます。(ポジションペーパー作成に大切な10のポイント On Sep 28, 2020 エナゴ)

Position Paper とは、議題に対する自国の立場や政策、およびそれらを支える論理を述べ
たものです。(Position Paper について Japan Committee for Global Classrooms)

ARO? CRO? CRC? 治験、臨床試験、臨床研究の違い

臨床研究を推進するにあたり、様々な専門家や業務が絡んできます。略称が飛び交うことが多いため、門外漢には全く何のことかわかりません。主要な言葉をまとめておきます。

臨床研究

人を対象として行われる医学的な研究のこと。

臨床試験

臨床研究の中でも特に、薬等の安全性を調べるための治療を兼ねた研究のこと。

治験

臨床試験の中でも特に、新薬や新しい医療機器に関して国の承認を得るために行われる試験

ARO:Academic Research Organization(アカデミック臨床研究機関)

AROの定義や使われ方は、状況に応じて狭かったり広かったりするようです。

ARO(AcademicResearchOrganization)大学や研究機関での研究を臨床研究主に臨床試験や医師主導治験)として適切に実施できるように支援する組織(ARO-CRC 教育ツール 解説書

 

Academic Research Organization (ARO)の定義 (新日本科学用語集)

  • 大学・研究所等のアカデミアにおいて臨床試験を推進、支援する組織
  • 大学(アカデミア)の有する多くの専門性や特徴を活用し、治験を収益事業として行う組 織

臨床研究中核病院における支援機能研究者からみたARO機能の活用

 

ARO:Academic Research Organizationの略。研究機関や医療機関等を有する大学等がその機能を活用して、医薬品開発等を含め、臨床研究非臨床研究を支援する組織をいう。(AMED

 

ARO の説明を求められた時に CRO のアカデミック版であるとの回答は簡便であるが正確ではなく,実際にはシーズ(基礎技術)探索ファンド獲得から臨床試験モニタリング総括報告書作成等,およそ基礎技術から医薬品・医療機器・再生医療等製品を実用化する上で必要なあらゆるプロセスを受け持っている.(Academic Research Organization の役割 日本臨床外科学会雑誌 77 巻

 

CRO

CRO(Contract Research Organization、開発業務受託機関

 

CRC(臨床コーディネーター)

臨床コーディネーター(clinical research coordinator; CRC).

 

  1. 治験コーディネーター(または臨床研究コーディネーター)とは、治験に参加する患者さん(被験者)の人権や安全性を守り、科学性、信頼性の高い治験を円滑に進められるように管理・調整する専門スタッフのことです。… 当センターでは、薬剤師看護師臨床検査技師管理栄養士などのスタッフがCRCとして治験実施のサポートをしています。(大阪市立大学医学部付属病院臨床研究・イノベーション推進センター

 

 

SMO

SMO(Site Management Organization:治験施設支援機関).

 

 

参考

  1. KOBEものわすれネットワーク
  2. 医師主導臨床研究計画立案の要点 〜効果的な研究計画の実施のために〜 日本医師会 臨床研究教育WG

 

シノプシスとは?臨床研究におけるプロトコールのドラフトのこと

臨床研究に関する話題で、シノプシスという言葉が普通に出てきます。一般の世界では聞きなれない言葉ですが、シノプシスとはいったい何でしょうか?

シノプシスとは

研究概要(シノプシス)は、臨床試験の重要な部分の抜粋(サマリー)です。… シノプシスは、読者がプロトコルの全文を読まずに、何(what)、なぜ(why)、どこ(where)、どのように(how)研究を実施するか主要なポイントについて理解することが出来ます。出典:臨床研究のプロトコルの概要を効果的なものにするための、5つの秘訣 by Dr. Dean Meyer Edanz-Learning-Japan April 17, 2020

シノプシスの中身

プロトコルシノプシスに最低限記載すべき項目
・研究目的
・研究デザイン
・対象集団(選択基準・除外基準)
・症例数
・エンドポイント

参考:医師主導臨床研究計画立案の要点 〜効果的な研究計画の実施のために〜 日本医師会 臨床研究教育WG

 

参考

  1. 臨床研究関連資料(各種ひな形)

 

ダークマターとは?

名前だけはよく耳にするダークマターですが、いったいダークマター(暗黒物質)とは何でしょうか?

ダークマターとは?

宇宙を構成するものの割合:物質5%、ダークマター27%、、ダークエネルギー68% (第6回:ダークマターを捕まえる 2014年4月 素粒子宇宙期限研究帰国 名古屋大学

ダークマターとの検出

僕たちはダークマターにはね飛ばされた原子核の飛跡をフィルムで捕らえます。(第6回:ダークマターを捕まえる 2014年4月 素粒子宇宙期限研究帰国 名古屋大学