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論文がリジェクト(却下)されるよくある理由

自分は今まで論文を出したときに、リジェクトされたことがたくさんありますが、一番多い理由は意義がそのジャーナルのレベルには達していないというものです。ただエディターからの手紙でリジェクトの理由としてはっきりとそう書いていることはあまりなくて、婉曲表現として、他の専門誌の方が合っているという言われ方をすることが普通だと思います。これが方便に過ぎないことは、論文投稿の経過が、Nature→Nature姉妹紙(専門誌)→Nature CommunicationsやScientific Reports(どちらも一般誌)という辿り方をすることを考えれば明らかでしょう。Nature姉妹紙(専門誌)に出したときに、もっと専門的な学術誌のほうがお似合いですよと言っておきながら、Scientific Reportsにはアクセプトされてりすることもありえるわけです。

意義の大きさが足りないこと以外に、よくあるリジェクト(エディターキック)の例は、out of scopeというものでしょう。つまり専門分野が違うのでうちの雑誌には載せられませんよというわけです。どうしてこのようなミスマッチが起こるのかというと、研究者としてはできるだけインパクトファクターが高い学術誌へ掲載したいわけです。となると多少専門分野が違うように見えてもとりあえずインパクトファクターが高いジャーナルからトライしてみたいという衝動にかられます。その結果として、out of scopeですよとか、うちの読者には合ってませんねと断われてしまうわけですね。

Most journals have a quite specific target audience, so they can get those people to subscribe to (and pay for) it.

https://www.quora.com/My-paper-was-rejected-because-it-was-out-of-scope-of-the-journal-said-the-editor-What-does-he-really-mean

上の説明がわかりやすいですね。お客さんは読みたいものを読むためにお金を払っているんだから、興味がない、分野外の論文がそこに混じっていたらうれしくないわけです。雑誌社としては、そんなことはできません。

 

論文を執筆する具体的な手順、各セクションの書き方

アウトラインから書く

論文を書くとき、いきなり文章を書き始めると、方向性が定まらず収拾がつかず、あとから全部を書き直すはめになります。まず骨格をしっかり定めて、次に肉付けするという手順を踏むことが非常に大事です。『迷走しない 英語論文の書き方』(ヴァランヤ・チョーベー著 講談社)で強調されている通りです。下のリンクの記事も非常に有用です。

  1. HANDOUT: FROM OUTLINE TO FIRST DRAFT Posted on July 6, 2019 SARAH (FRANKIE) FRANK  https://dept.writing.wisc.edu/wac/handout-from-outline-to-first-draft/

イントロダクションに何を書くか

イントロダクションを書く目的、何を書くべきかに関しては、下の説明が、全てを言い尽くしていると思います。

  1. Writing an Introduction for a Scientific Paper Posted on August 20, 2017 Dr. Michelle Harris, Dr. Janet Batzli, https://dept.writing.wisc.edu/wac/writing-an-introduction-for-a-scientific-paper/ If the Introduction is done well, there should be no question in the reader’s mind why and on what basis you have posed a specific hypothesis.

 

うつ病と運動療法

  1. うつ病の運動療法 https://www.jstage.jst.go.jp/article/jjrmc/55/3/55_189/_pdf
  2. うつ病運動療法の現状と展望 https://www.jstage.jst.go.jp/article/stresskagakukenkyu/28/0/28_20/_pdf
  3. うつ病患者における運動プログラムの効果検証 https://www.health-net.or.jp/tyousa/josei/pdf/h29/h29houkoku_ishii.pdf
  4. https://www.igakuken.or.jp/r-info/covid-19-info207.html 運動療法は、うつ病の非薬物治療として注目されているが、まだ、治療法として確立されていない。
  5. https://cocoromi-mental.jp/depression/dep-exercise/ 活動的な人は不活発な人よりもうつ症状の発症リスクが、15~25%低い
  6. https://www.abeclinic.com/exercise/?page_id=42 運動がうつ病患者さんに対して治療的に働く、つまり症状を改善させるという報告は次第に増えています。
  7. https://dm-net.co.jp/calendar/2024/038146.php

ミトコンドリア病、Pol G(DNAポリメラーゼγ)遺伝子変異など

(CNN) ルクセンブルク大公国のフレデリック王子が、「POLG」と呼ばれる難病で長年の闘病の末、今月1日にパリで死去した。王子が2022年に創設したPOLG財団のウェブサイトで遺族が発表した。https://www.cnn.co.jp/world/35230277.html

ルクセンブルグの王子がPOLGという難病で亡くなったというニュースがありました。POLGというのは、polymerase gamma 遺伝子に変異があるためにミトコンドリアDNAの複製が上手くできなくて、ミトコンドリアの機能が損なわれる疾患だそうです。

This replication of mitochondrial DNA happens independently from the cell cycle and is performed by the enzyme polymerase γ. Polymerase γ is encoded for in the cell nucleus by the two genes PolG as well as PolG2. More than 200 mutations in PolG have been described that are associated with disease. https://polgfoundation.org/what-is-polg/

PolG遺伝子自体はミトコンドリアDNAによってコードされるわけではなく、核内のDNAによってコードされるようです。

遺伝学的検査
特異度が高い。POLG、PDHA1、SURF1などのミトコンドリア関連分子をコードする核遺伝子の病的バリアントを認める(Gorman GS, et al. Nature Reviews Disease Primers 2, Article number: 16080, 2016; Frazier AE, et al. J Biol Chem 294:5386-5395, 2019等を参照)。 https://www.nanbyou.or.jp/entry/335

PolG酵素は、触媒反応を担うPolG1と、アクセサリーユニットのPolG2からなる複合体だそう。

  1. https://www.jstage.jst.go.jp/article/clinicalneurol/54/5/54_417/_pdf/-char/ja

これまで報告されているミトコンドリア病を起こす遺伝子(核DNAとmtDNA)

  1. https://www8.cao.go.jp/cstp/tyousakai/life/haihu98/shiryo5-1.pdf

PLOGに関する文献など

  1. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8796686/
  2. https://umdf.org/polg/

POLGと躁うつ病との関連

  1. 躁うつ病モデルマウス A model for bipolar disorder ミトコンドリアDNA合成酵素 (POLG) 変異体トランスジェニックマウス Mitochondorial DNA polymerase (POLG) mutant transgenic mouse https://mus.brc.riken.jp/ja/mouse_of_month/may_2006_mm

ミトコンドリアとうつ病との関連

  1. ミトコンドリアの異常がうつ・不安を引き起こす~新しい治療薬の創薬標的として期待~ 広島大学 プレスリリース 令和5年
  2. ミトコンドリア病の中には神経筋症状に 加えて統合失調症うつ病などの精神症状を 呈する例がある。ミトコンドリア病にみられる 神経筋症状に加え、うつ、統合失調症、認知症、 人格変改などの精神症状やを呈し、ミトコンド リア DNA (mtDNA)変異を有する 5 症例について 遺伝子解析結果と、それぞれの精神症状につい て報告する。 https://mhlw-grants.niph.go.jp/system/files/2013/133151/201324019A_upload/201324019A0012.pdf

参考

  1. http://grj.umin.jp/grj/mt-overview.htm
  2. https://www.juntendo.ac.jp/branding/report/researchfrontiers01/
  3. https://www.shouman.jp/archives/print/print_8_4_56_01.pdf

電池ってなぜ「減る」の?何が減るの?電池の働く仕組みは?

問い:電池はなぜ減るの? 原理をわかりやすく教えて。

ChatGPT:

電池が減る(=電池のエネルギーがなくなる)理由は、化学反応によって電気を作り出しているからです。

電池の仕組み(簡単な説明)

  1. 電池の中には2種類の金属(+極と−極)がある
    • +極(正極):電子を受け取る
    • −極(負極):電子を出す
  2. 電解液という液体が金属の間をつなぐ
    • この液体の中で化学反応が起こる
  3. 電池を使うと、電子が−極から+極へ流れる
    • これが「電流」となり、電気を作り出す
  4. 化学反応が進むと、だんだん電子を出せなくなる
    • その結果、電流が流れなくなり、電池が減っていく

もっと簡単にいうと?

  • 電池のエネルギーは、化学反応で生まれる!
  • 使うと化学反応が進み、やがて反応できなくなる!
  • だから、電池は減る!

充電式の電池は、この化学反応を逆にして元に戻せるから、また使えるようになるんだよ!

質問:具体的な物質名と化学反応で説明して。

電池のエネルギーが減る理由(化学的な説明)

電池が電気を生み出すのは、**酸化還元反応(電子のやり取り)**によるものです。ここでは、アルカリ電池(よく使われる乾電池)を例に、どんな化学反応が起きるのか説明します。


1. アルカリ電池の構成

  • 負極(−極):亜鉛(Zn)
  • 正極(+極):二酸化マンガン(MnO₂)
  • 電解液:水酸化カリウム(KOH、水溶液)

2. 放電時の化学反応(電池を使うとき)

🔋 負極(−極)での反応(酸化反応)
亜鉛(Zn)が電子を放出し、水酸化亜鉛(Zn(OH)₂)になります。

Zn+2OHZnO+H2O+2e\text{Zn} + 2\text{OH}^- → \text{ZnO} + \text{H}_2\text{O} + 2e^-

🔋 正極(+極)での反応(還元反応)
二酸化マンガン(MnO₂)が電子を受け取り、水酸化マンガン(MnOOH)になります。

2MnO2+2H2O+2e2MnOOH+2OH2\text{MnO}_2 + 2\text{H}_2\text{O} + 2e^- → 2\text{MnOOH} + 2\text{OH}^-

🔋 全体の反応式

Zn+2MnO2+H2OZnO+2MnOOH\text{Zn} + 2\text{MnO}_2 + \text{H}_2\text{O} → \text{ZnO} + 2\text{MnOOH}


3. なぜ電池が減るのか?

  • 亜鉛(Zn)が消費される → 反応できる亜鉛がなくなる
  • MnO₂も消費される → 反応できる二酸化マンガンがなくなる
  • 電流を流すための電子の供給が止まる → 電池が使えなくなる

4. 充電式電池との違い

  • ニッケル水素電池(NiMH)やリチウムイオン電池(Li-ion)は、化学反応を逆にできる!
  • 充電すると、電子を戻して物質を元の状態にすることで、また使えるようになる。

まとめ

電池は、酸化還元反応を使って電気を作る。
しかし、反応に必要な物質(亜鉛やMnO₂)がなくなると、電流が流れなくなり、電池が減る(=使えなくなる)。

充電式電池は、この反応を逆にできるから、繰り返し使えるんだよ!

質問:電子を出す、受け取るというのは、電極同士を電線で結んだときに電線を流れるということ?それとも、電池内で?

ChatGPT:

いい質問!

電子のやり取りは「電池の中」と「電線の中」の両方で起こるけど、それぞれ役割が違うんだ。


① 電池の中で起こること(化学反応)

  • 負極(−極):電子を出す
    • 亜鉛(Zn)が電子を放出し、Zn²⁺(イオン)になる。
  • 正極(+極):電子を受け取る
    • 二酸化マンガン(MnO₂)が電子を受け取り、変化する。
  • 電子は電池の中の電解液(KOH)を通らない!
    • 電解液は「イオン」が移動するだけで、電子は流れない!

② 電線を流れる電子(電流)

  • 電極同士を電線でつなぐと、電子が外の電線を通って流れる!
    • 負極(亜鉛)から電子が出て、電線を通り、正極(二酸化マンガン)へ向かう。
    • この電子の流れが「電流」として機器(電球やスマホ)を動かす!

簡単にまとめると…

電池の中では、化学反応で電子を「出す・受け取る」
電池の外(電線)を電子が移動することで、電気が流れる!
電解液は「電子の通り道」ではなく、イオンが移動するだけ!

だから、電池を使っているときに流れている電子は、電池の中ではなく、電線の中を流れているんだよ!

自分:つまり、電池は酸化還元反応そのものってわけね?

ChatGPT:

その通り!電池はまさに「酸化還元反応そのもの」なんだ! 🔋✨

電池の基本的な仕組みをもう一度整理すると…

  1. 負極(−極)で酸化反応
    • 例:亜鉛(Zn)が電子を放出してZn²⁺になる(=酸化)
    • この電子は電線を通って正極へ移動する
  2. 正極(+極)で還元反応
    • 例:二酸化マンガン(MnO₂)が電子を受け取る(=還元)
  3. この電子の流れが「電流」として機器を動かす!

💡 つまり、電池は酸化還元反応を使って「化学エネルギー → 電気エネルギー」に変換する装置なんだよ!

肺高血圧症 pulmonary hypertensionとは

肺高血圧症とは

  • 肺動脈の血液の流れが悪くなることで、肺動脈の血圧が高くなる病気
  • 放置すると命にかかわる
  • 肺動脈の血液が流れにくくなると肺の血圧が高くなり、心臓と肺をつなぐ肺動脈に負担がかかる
  • 肺動脈の血液の流れが悪くなるため、全身をめぐる酸素の量が不足する
  • 少し動くと息苦しくなる・息切れがするといった症状
  • 平均肺動脈圧が25mmHg以上(近いうちに20mmHgに変更される可能性)で肺高血圧症と診断
  • 肺動脈圧が高くなる原因はさまざまで、肺小動脈の狭窄血栓症左心性疾患など
  • 右心室はもともと高い圧力に長期間耐えられるようにはできていないので、やがて右心は拡大し、機能が低下して右心不全が進む
  • 悪化すると、少し動くだけで息苦しさを感じ、立ち上がるだけでも気を失いかけたりし、お腹に水がたまったりし、チアノーゼ(全身に酸素が十分に行きわたらず、皮膚や唇などの粘膜が青みを帯びてくること)を起こしたりする。

参考

  1. 国立循環器病研究センター https://www.ncvc.go.jp/hospital/pub/knowledge/disease/pph/

 

下の動画はそもそも肺高血圧症とは何かというところからスタートして、いろいろな話題に触れています。

What’s New in Pulmonary Hypertension Treatment? – Dr. Cuttica and Dr. Mylvaganam Scleroderma Foundation of Greater Chicago チャンネル登録者数 1760人

 

Brittany NJ Davis, Hunter C Champion Pulmonary Arterial Compliance and the FREEDOM-EV study 04 Feb 2025 Animated Videos Cardiopulmonary & Vascular Medical Devices & Pharmaceuticals Video Journal of Biomedicine | Animated Videos Video Journal of Biomedicine (2025) doi: 10.1080/vjbm-2024-0002 https://www.biomedicine.video/cardiopulmonary-vascular/pulmonary-arterial-compliance-and-the-freedom-ev-study 動画による解説

動脈硬化の進行

動脈硬化が進行して血栓ができて心筋梗塞などで突然死するまでの仕組みが下のリンクの記事で分かりやすい図によって説明されていました。

  1. 動脈硬化の進展と血清脂質 https://tgnavi.net/pdf/medical_support_tool07.pdf この図は非常にわかりやすい!

参考

  1. https://www.nature.com/articles/srep10225
  2. https://www.ahajournals.org/doi/10.1161/circresaha.114.302721
  3. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0735109719361613
  4. 動脈硬化はなぜ起こる? その原因と治療 動脈硬化の危険因子と進展のメカニズム https://kekkan-kenko.com/medical/mt17/ 「亭主を早死にさせる10カ条」①太らせ、②お酒を飲ませ、③運動させず、④肉をたくさん食べさせ、⑤塩分の多い物を与え、⑥カフェインたっぷり、⑦タバコをすすめ、⑧夜更かしさせ、⑨旅行にも行かさず、⑩終始文句をいっていじめる
  5. 動脈硬化症の 1 次予防(EBMに基づく内科的治療) https://www.jstage.jst.go.jp/article/naika/99/3/99_447/_pdf
  6. 動 脈 硬 化 の 進 展 と リス ク ファ ク タ ー https://www.jstage.jst.go.jp/article/jjcdp1974/20/1/20_1_38/_pdf/-char/ja

肺容量のグラフの読み取り方

看護試験 https://www.kango-roo.com/kokushi/kako/detail/10436/1 の図が分かりやすいですが、肺の体積(肺容量)を縦軸に、時間を横軸にとってグラフを描くと、呼吸の様子を図示できます。通常は、息を吸ったり吐いたりするときに、最大限、最小限の吸い方や吐き方はしないので、小さな波として呼吸が示されます。波が上がっていって頂点になったときが、息を吸いこんで吐く方向に変化する直前です。波が下がっていくときは息を吐いている状態です。SINEカーブのような波の一番下の谷の部分は息を自然に吐き切った状態になります。

大きく、めいいっぱい吸い込むと波はもっと大きくなります。肺容量の数値が大きな値を示します。そこから思いっきり息を吐くと、通常の呼吸時の谷よりもさらに深いところまで肺容量は小さくなっていきます。この、肺容量の下限と上限の差が、肺活量になります。

同じずですが、英語の論文でも見られます。https://www.mdpi.com/1424-8220/22/24/9680

科研費に落ちちゃったんですけど、何が悪かったんでしょうか?

ChatGPTの答え:

科研費に落ちてしまった原因を考えるポイント

科研費は競争が激しく、審査で何が評価されるかを分析し、次回の申請につなげることが重要です。以下の視点から原因を考えてみましょう。


1. 評価コメントの分析

審査員のコメント を確認し、以下の点をチェックしてください:

  • 研究の独創性新規性が弱い、既存研究との差別化が不十分)
  • 研究計画の妥当性方法が曖昧、実現可能性が低い)
  • 研究の意義・波及効果インパクトが不足、学術的または社会的意義が不明確)
  • 申請書の完成度文章が分かりにくい、構成が論理的でない)
  • 予算の適正さ(過大・過小見積もり、費用の合理性に欠ける)

審査コメントがなかった場合
他の科研費採択者の申請書を参考にして、自分の申請書のどこが弱かったのか を比較してみると良いでしょう。


2. 申請書の内容に問題があったか?

以下のような点に心当たりがないかチェックしてみてください。

(1) 研究の新規性や独創性が明確でなかった

  • 既存研究との差別化が十分に説明されていたか?
  • なぜ今、この研究が必要なのか?」の説明が強調されていたか?

(2) 研究計画が実現可能であることを示せていたか

  • 具体的な研究スケジュール方法論が詳細に記載されていたか?
  • リスクマネジメント予想される問題とその対応策)についても触れていたか?

(3) 研究のインパクトが弱かった

  • 科学的・社会的な意義や応用可能性を明確に説明できていたか?
  • 「この研究が成功したら何が変わるのか?」を強調できていたか?

(4) チームの実行力を示せていたか

  • 申請者自身やチームメンバーの実績が十分に説明されていたか?
  • 研究遂行に必要なスキル・リソースがあることを示せていたか?

(5) 予算計画が適切だったか

  • 予算の使い道が具体的かつ合理的であることを説明できていたか?
  • この費用がなぜ必要なのか?」を明確にできていたか?

3. 他の要因

(1) 競争率の問題

  • 競争が激しいため、十分な評価を得ても採択されないことがあります。
  • 「今年は応募数が多かった」「同分野の強力なライバルが多かった」など、外的要因も考慮する必要があります。

(2) 研究分野のトレンド

  • 現在の学術トレンドや政策との適合性が問われることもあります。
  • SDGs、AI、バイオテクノロジー、DX など、国が推奨する方向性と合致していたか?

(3) コミュニケーション不足

  • 申請前に科研費経験者にフィードバックをもらったか
  • 研究室内や他の研究者と申請書を比較し、客観的なアドバイスを受けたか?

4. 次回に向けて

  • 過去の採択者の申請書を入手し、自分の申請書と比較してみる。
  • 科研費の審査委員経験者(特に同分野の研究者)に申請書を見てもらい、アドバイスを受ける。
  • 予算や研究計画の練り直しを行い、より説得力のある申請書を作成する。
  • 分かりやすく、読みやすい文章にする(審査員は短時間で多くの申請書を読むため、簡潔で伝わりやすいことが重要)。

結論:何が悪かったのかを分析し、次回の申請に生かすことが大切です!
もし申請書を見直したい場合、内容の改善点を一緒に考えましょう。

ChatGPT, 生成AIとは何か

今更ですがChatGPT, 生成AIとは何かについての情報のまとめを。

 

黒橋禎夫先生「ChatGPTの仕組みと社会へのインパクト」京大知の森(R5秋季) Kyoto University / 京都大学 チャンネル登録者数 1.35万人 2024/01/12