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頭の良さ、論理的思考能力、国語力について

頭がいい悪いは、学校ではテストの成績で測られて、成績でお互い頭がいい悪いという印象付けが行われることが多いかもしれませんん。しかし、テストで測っているものは本当に頭の良さでしょうか。頭の良さを測るために作られた問題であっても、テスト勉強をした学生が、とりあえず知識を詰め込んで何とか対象してテストの点数だけは取れてしまったということも起こりえます。数学の問題を解くときに、与えられたものを素直に見て取り組んで論理的思考によって答えを得るのではなく、予め詰め込んでおいた解法のパターンと照らし合わせて、この問題はアレだ!みたいに当てはめるやり方です。あるいは、英語の長文をちゃんと頭から文法に則って読むことをせずに、単語の意味だけを拾って、なんとなく意味が通りそうな文を作り上げると、ある程度は英語の問題も解けてしまうといった具合です。

実はテストで同じ点数を取った学生が二人いたとしても、その二人のテスト勉強のやりかたにそのような差があった場合は、もはやそのテストは頭の良さを正しく測定できたとはいえないのです。

分けること

自分の周りにある様々なものを、分けて考えることが第一歩です。机と椅子。人間と犬。大人と子供。自分と他人。netherthelessとnonetheless。何が同じで何が違うのか、同じカテゴリーにまとめていいのか、違うのか。物事が理解できていない場合、何かと何かを混同してしまっていて区別がついていないということがしばしばあります。

抽象―具体の階層に分けること

リンゴ、ミカン、バナナ、つまり果物。肉、魚、野菜、つまり食べ物。あらゆるものは、抽象度、具体度によって同じ階層の同じグループかどうかに分類できます。「度」というときには、何かしらの基準が必要です。果物と言う場合には、そもそも果物とは何かが定義されていないといけません。定義がされいてはじめて、椅子が果物かどうかの議論ができます。カメの甲羅は骨かどうかなど。

CEME

分けるときに大事な観点は、全てのモノが分類対象になるようにすることです。果物とそれ以外とすれば、果物の定義を満たすものは果物に分類され、果物の定義を満たさないものは「それ以外」に分類できます。

関連性

原因と結果。因果関係はないが相関していることなど。喫煙者であることと、タバコを携帯していることとは因果関係があります。タバコを携帯していることと、携帯用灰皿を持っていることとは、直接は因果関係にありません。喫煙者であることを通じて両方が「結果」になっており、相関しているのです。

論理

「命題」(主張)と「命題」(主張)との間の関連性です。命題をpやqで表すと、pならばqと言った具合です。そのときにqはpであるための必要条件であり、pはqであるための十分条件であると言った言い方をします。

推論

演繹、帰納が有名です。アブダクション、アナロジーというものもあります。

 

 

MECE(ミーシー)とは?

MECE(Mutually Exclusive and Collectively Exhaustive)は、要素が互いに重ならず、かつ全体を漏れなく網羅する状態を指します。アイスクリームの分類で、MECEを意識した分け方の例を見ていきましょう。

MECEに基づいたアイスの分類

例えば、「味の種類」でアイスクリームを分類するとします。この際、次のように分けると、MECEの要件を満たしやすくなります。

主要なフレーバーを以下のように分けると、漏れがなく、明確な分類が可能です。

  1. ミルク系:バニラ、ミルク
  2. チョコレート系:チョコレート、チョコチップ
  3. フルーツ系:ストロベリー、マンゴー、ブルーベリーなど
  4. 和風フレーバー:抹茶、黒ゴマ、小豆
  5. その他のフレーバー:キャラメル、クッキー&クリーム、コーヒーなど

がん抑制遺伝子RB, p53, p21の働き

がん細胞ではしばしば、がん抑制遺伝子RB, p53などの変異が見られます。野生型のRBやp53の本来の働きはどのようなものなのでしょうか。

p53は転写因子で、CDKN1A遺伝子(遺伝子産物はp21と呼ばれるたんぱく質)の発現をオンにします。p21はCDKと結合することにより、CDKがRBをリン酸化することを抑制します。RBはリン酸化されていない場合には、転写因子E2Fと結合することにより、様々な細胞周期を進行させる遺伝子の発現をオフにしています。

p53の働きがもしなくなってしまうと、p21が発現されなくなり、その結果CDKに対する抑制が解除されて、CDKはRBをリン酸化します。リン酸化されたRBはE2Fと結合できずに標的遺伝子のDNAから離れていきます。その結果、細胞周期を進行させる遺伝子群の転写がオンになり、細胞周期が進行することになるわけです。

Cell cycle regulation: p53-p21-RB signaling Kurt Engeland Cell Death & Differentiation volume 29, pages946–960 (2022) https://www.nature.com/articles/s41418-022-00988-z

 

科学研究論文の書き方

科学研究論文には作法があります。作法を知らずになんとなく書いていても、決して良い論文は書けません。作法を学ぶベストな方法は、良い論文を読んで分析してみて、それを真似することだと思います。

仮説の提示

科学研究の作法は、仮説の検証です。ですから論文では仮説を提示する必要があります。We hypothesized that ~というのが一番あからさまな仮説の提示方法ですが、必ずしもhypothesizeという言葉を使う必要はありません。疑問の形だったり、知識のギャップに言及する形でも、間接的に仮説を提示することが可能です。

例 Despite the experimental tractability of developmentally patterned processes in mice, a molecularly specified neural circuit that governs male mating remains to be defined. マウスにおける定型的な発生過程は実験的に操作しやすいがそれにもかかわらず、オスの交尾行動を支配する分子的に特定された神経回路はまだ同定されていない。https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)00798-5

上の例文では、知識のギャップを提示していますが、そこで暗に示されている仮説は、「分子的に規定された神経回路によって交尾行動は支配されている」というものです。

別の論文の例も観てみましょう。

例  It is unknown whether multiple or a single neuronal type is responsible for the control of mammalian locomotion. 哺乳類における運動の制御が複数の神経細胞タイプによって担われているのか、それとも単一の神経細胞タイプが担っているのかは不明である。https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01452-5

知識のギャップの提示していますが、同時に、「運動の制御を担うのは1種類の細胞であるか、それとも、複数種類の細胞であるか」という仮説の提示にもなっています。

二次神経形成 secondary neurulation

外胚葉の一部が神経板になり、それが内側に折れ込んで管を作るのは、一次神経形成 primary neurulationと呼ばれます。それに対して、中胚葉の細胞が凝集して棒状になり、内部に空隙ができることで神経管ができるものをsecondary neurulationと呼びます。secondary neurulationは主として、尻尾の部分で生じます。ヒトには尾がないので、secondary neurulationは顕著ではありません。

下の図で、(a)が一次神経形成による神経管のできかた(管の断面図)。(b)が二次神経形成における神経管のできかた。管をつくるのに、こんなに方法が違っていてもいいというのは驚きです。

https://www.sciencedirect.com/topics/immunology-and-microbiology/neurulation

  1. 神経管 脳辞典 https://bsd.neuroinf.jp/wiki/神経管 哺乳類や鳥類胚の尾部においては、中胚葉性間葉細胞の上皮化による神経管の形成が見られ、この様式は二次神経形成 (secondary neurulation) と呼ばれている。

下の図が非常にわかりやすい。マウスの尾部ではSecondary neurulationが生じることが一目でわかります。

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0925477304001133

ホップフィールドネットワーク(Hopfield Network)とは?

ホップフィールドネットワーク(Hopfield Network)は昔から名前は知っているのですが、何かという理解は全くしていませんでした。そうこうするうちにホップフィールドさんは2024年度ノーベル物理学賞を獲ってしまいました。

わかりやすい巷の解説のリンク集をつくっておきます。

  1. https://ml-jku.github.io/hopfield-layers/
  2. https://developers.agirobots.com/jp/deep-learning-2020-hopfieldnetwork/
  3. http://cda.psych.uiuc.edu/matlab_pdf/nnet.pdf  MATLAB Neural Network Toolbox User’s Manual

アプタマーセンサーによるコルチゾールのリアルタイム検出

アプタマーがなぜコルチゾールのセンサーになるのかについて

aptamerを用いてコルチゾールをリアルタイムで測定するための原理は、通常、アプタマーとターゲット分子(この場合はコルチゾール)との特異的な結合を利用します。アプタマーは、特定のターゲット分子に対して高い親和性と選択性を持つ短い一本鎖DNAやRNAのオリゴヌクレオチドです。この特性を利用して、以下のような手法でリアルタイム測定が行われます。

  1. アプタマーの結合と構造変化:
    • アプタマーは、コルチゾールと結合することでその構造が変化します。この構造変化を検出するために、蛍光標識や電気化学的な検出システムを用いることがあります。
    • 例えば、蛍光標識を用いる場合、アプタマーに蛍光物質と消光剤が結合しており、アプタマーがコルチゾールと結合することで蛍光が変化する仕組みです。これにより、蛍光の変化量をリアルタイムでモニタリングし、コルチゾール濃度を測定することが可能です。
  2. 電気化学的検出:
    • アプタマーが電極上に固定され、コルチゾールと結合することで電気化学的な信号が変化することを利用する手法もあります。コルチゾールの結合によるアプタマーの構造変化が、電気的インピーダンスや電流応答に変化を与えるため、これをリアルタイムで測定してコルチゾール濃度を評価します。
  3. 比率型蛍光アプタマーセンサー:
    • コルチゾールに応じて蛍光強度が変わるように設計された二重ラベルアプタマーを使うことで、環境条件や光路の影響を受けにくい安定したリアルタイム測定が可能になります。この方法では、蛍光の比率変化を測定することで、正確なコルチゾール濃度を得ることができます。

これらの方法のいずれも、アプタマーの高い特異性を利用してコルチゾールと選択的に結合させ、その結合の変化をリアルタイムで検出することで測定を行います。これにより、ストレスホルモンであるコルチゾールの変動をリアルタイムに追跡することが可能になります。

(ChatGPT 4o)

アプタマーがそもそもなぜコルチゾールに結合できるのかについて

核酸アプタマーがコルチゾールのような小さな分子に結合できる理由は、主に以下のような核酸アプタマーの特性に基づいています。

1. 高い構造多様性と適応性:

  • 核酸(DNAやRNA)は、塩基配列の組み合わせによって多様な三次元構造を形成することができます。これにより、アプタマーは特定のターゲット分子に適した形状や結合ポケットを形成できます。
  • アプタマーは、一本鎖のDNAやRNAであるため、ランダムコイル状の構造から、ターゲット分子に結合する際に立体的に適した形に変化できます。これにより、コルチゾールのような小さな分子の形状や化学特性にぴったり合うように折りたたまれることが可能です。

2. 非共有結合的相互作用(特に水素結合や疎水性相互作用):

  • コルチゾールはステロイドホルモンで、疎水性の領域と極性を持つ部分(例えば、酸素や水酸基)があります。アプタマーの特定の塩基配列がこれに対応するような立体構造を形成することで、コルチゾールの疎水性部分とアプタマーの疎水性ポケットとの間で疎水性相互作用が発生します。
  • また、コルチゾールの極性基(水酸基など)とアプタマーの塩基間で水素結合を形成することができ、これが結合の特異性と強さをもたらします。核酸の塩基(アデニン、シトシン、グアニン、チミンまたはウラシル)は、それぞれ特定の水素結合を形成する能力を持っているため、ターゲットに対して高い親和性を発揮します。

3. SELEX法による選択プロセス:

  • アプタマーが特定の分子(コルチゾールなど)に強く結合する能力は、一般にSELEX(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment)という技術によって得られます。この技術では、ランダムな塩基配列からなる巨大なライブラリー(数十億種類のアプタマー)を使って、コルチゾールに強く結合するアプタマーを選び出します。
  • SELEXプロセスでは、コルチゾールに対して最も強く、そして選択的に結合するアプタマーが繰り返し選択され、最終的には高い親和性と特異性を持つアプタマーが得られます。このようにして、核酸がコルチゾールのような分子に結合するための「形」や「結合部位」を持つようになります。

4. 結合の可逆性とリアルタイム測定:

  • アプタマーとコルチゾールとの結合は非共有結合的な相互作用に基づくため、可逆的であり、リアルタイムでの濃度変化の測定が可能です。アプタマーは、コルチゾールが増減するたびに結合・解離を繰り返し、これを検出装置でモニタリングすることで、リアルタイムでの測定が実現します。

核酸が持つこのような柔軟性と選択的な相互作用の特性により、アプタマーはコルチゾールを含む様々な小分子をターゲットにできるのです。

(ChatGPT 4o)

アプタマーの長さについて

コルチゾールに結合するアプタマーの具体的な例として、研究で報告されているものをいくつか挙げることができます。アプタマーの塩基配列や長さは、研究者によって最適化されたものが使われており、SELEX法によって選別されています。一般的に、コルチゾール結合アプタマーは20〜80塩基程度の長さで設計されていますが、より高い特異性や親和性を得るために、その長さや配列が調整されます。

1. 例:研究での報告例

  • コルチゾールに特異的に結合するアプタマーの一例として、以下のような配列が報告されています(具体的な研究例を引用する形ではなく、一般的な範囲を示します):
    swift
    5'- TCG TCA GAC GAG CAT CGG ATA GTT TGA CGA CAG TCC ATC CGC TGG ATC GAC C -3'

    このような配列は、ターゲットであるコルチゾールとの結合部位を形成するために特定の二次構造(ステムループ構造やヘアピン構造など)を取るように設計されています。

2. 一般的な長さ

  • アプタマーの長さは、通常20〜80塩基の範囲にあり、30〜50塩基が標準的な長さです。この範囲が一般的である理由は、短すぎると特異的な結合サイトを十分に形成できない一方、長すぎると非特異的な結合や構造が増えてしまうためです。したがって、コルチゾールに対して適切に結合するための二次構造を安定して形成できる長さが選ばれます。

3. 配列の役割

  • アプタマーの配列は、コルチゾールの分子構造に合わせて、水素結合や疎水性相互作用を適切に行えるように設計されています。例えば、塩基配列中の特定のG(グアニン)やC(シトシン)の位置は、結合の強さを高めるための水素結合の形成に関与することが多いです。また、アプタマー全体の立体構造が、コルチゾールがフィットするポケットのような形状をとるように、選択された配列が配置されています。

具体的な研究文献や特許に基づく配列を示す場合、より詳細な情報を得るためには、各研究論文や特許文献を参照する必要があります。

(ChatGPT 4o)

論文

アプタマーその他の手法を用いたコルチゾールの定量

  1. Advancements in Cortisol Detection: From Conventional Methods to Next-Generation Technologies for Enhanced Hormone Monitoring ACS Sens . 2024 Apr 26;9(4):1666-1681. doi: 10.1021/acssensors.3c01912. Epub 2024 Mar 29. https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssensors.3c01912 網羅的でなかなかよい
  2. Recent advances in aptamer-based platforms for cortisol hormone monitoring Talanta . 2024 Jan 1;266(Pt 1):125010. doi: 10.1016/j.talanta.2023.125010. Epub 2023 Jul 31.
  3. Advances in electrochemical biosensor design for the detection of the stress biomarker cortisol Anal Bioanal Chem . 2024 Jan;416(1):87-106. doi: 10.1007/s00216-023-05047-1. Epub 2023 Nov 22. https://link.springer.com/article/10.1007/s00216-023-05047-1 このレビュー論文もわかりやすそう。
  4. Wearable and Implantable Cortisol-Sensing Electronics for Stress Monitoring Adv Mater . 2024 Jan;36(1):e2211595. doi: 10.1002/adma.202211595. Epub 2023 Nov 20.
  5. A Gold Nanoparticle-Based Cortisol Aptasensor for Non-Invasive Detection of Fish Stress Biomolecules 2024, 14(7), 818; https://doi.org/10.3390/biom14070818 https://www.mdpi.com/2218-273X/14/7/818
  6. Electrochemical Aptasensing for Lifestyle and Chronic Disease Management Curr Med Chem . 2023;30(8):895-909. doi: 10.2174/0929867329666220520111715.
  7. A wearable sweat electrochemical aptasensor based on the Ni–Co MOF nanosheet-decorated CNTs/PU film for monitoring of stress biomarker Talanta Volume 260, 1 August 2023, 124620 Talanta https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0039914023003715
  8. DNA super-lattice-based aptasensor for highly sensitive and selective detection of cortisol Author links open overlay panel Lory Cantelli a , Waldemir J. Paschoalino a , Sergio Kogikosky Jr. a b , Tatiana M. Pessanha a , Lauro T. Kubota a Biosensors and Bioelectronics: X Volume 12, December 2022, 100228 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590137022001212 本文へは所属機関経由でアクセス可能
  9. Molecularly Imprinted Polymer-Based Sensor for Electrochemical Detection of Cortisol Biosensors (Basel) . 2022 Nov 29;12(12):1090. doi: 10.3390/bios12121090.  https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36551057/
  10. Wearable Cortisol Aptasensor for Simple and Rapid Real-Time Monitoring Jai Eun An 1, Kyung Ho Kim 1, Seon Joo Park 1, Sung Eun Seo 1, Jinyeong Kim 1, Siyoung Ha 1, Joonwon Bae 2, Oh Seok Kwon 1 3 Affiliations Expand PMID: 34995062 DOI: 10.1021/acssensors.1c01734 ACS Sens . 2022 Jan 28;7(1):99-108. doi: 10.1021/acssensors.1c01734. Epub 2022 Jan 7.
  11. Molecularly imprinted electrochemical aptasensor based on functionalized graphene and nitrogen-doped carbon quantum dots for trace cortisol assay Analyst, 2022,147, 744-752 https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2022/an/d1an01838h
  12. DNA super-lattice-based aptasensor for highly sensitive and selective detection of cortisol Biosensors and Bioelectronics: X Volume 12, December 2022, 100228
  13. Flexible electrochemical aptasensor for cortisol detection in human sweat Anal. Methods, 2021,13, 4169-4173
  14. Cortisol Detection in Undiluted Human Serum Using a Sensitive Electrochemical Structure-Switching Aptamer over an Antifouling Nanocomposite Layer 2021 https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/ay/d1ay01233a https://www.researchgate.net/publication/354935726_Cortisol_Detection_in_Undiluted_Human_Serum_Using_a_Sensitive_Electrochemical_Structure-Switching_Aptamer_over_an_Antifouling_Nanocomposite_Layer#fullTextFileContent
  15. Autonomous, Real-Time Monitoring Electrochemical Aptasensor for Circadian Tracking of Cortisol Hormone in Sub-microliter Volumes of Passively Eluted Human Sweat December 31, 2020  https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssensors.0c01754
  16. Stress Biomarkers in Biological Fluids and Their Point-of-Use Detection ACS Sens . 2018 Oct 26;3(10):2025-2044. doi: 10.1021/acssensors.8b00726. Epub 2018 Oct 16.  https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssensors.8b00726 
  17. Current and Potential Developments of Cortisol Aptasensing towards Point-of-Care Diagnostics (POTC) Sensors (Basel) . 2017 May 22;17(5):1180. doi: 10.3390/s17051180.  https://www.mdpi.com/1424-8220/17/5/1180

四肢の形成機構

AER

www.frontiersin.org

Activation of the WNT-BMP-FGF Regulatory Network Induces the Onset of Cell Death in Anterior Mesodermal Cells to Establish the ANZ Front. Cell Dev. Biol., 08 November 2021 Sec. Cell Death and Survival Volume 9 – 2021 | https://doi.org/10.3389/fcell.2021.703836

 

 

Front. Genet., 07 January 2019 Sec. Stem Cell Research Volume 9 – 2018 | https://doi.org/10.3389/fgene.2018.00705 This article is part of the Research Topic FGF10 in Development, Homeostasis, Disease and Repair After Injury View all 19 articles Fibroblast Growth Factor 10 and Vertebrate Limb Development https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2018.00705/fullwww.frontiersin.org

 

2017年 https://anatomypubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/dvdy.24480

ニワトリの四肢形成

Developmental Biology Volume 273, Issue 2, 15 September 2004, Pages 361-372 Developmental Biology The roles of Fgf4 and Fgf8 in limb bud initiation and outgrowth https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0012160604004282 

 

マウスの四肢形成

Early developmental arrest of mammalian limbs lacking HoxA/HoxD gene function Save Related Papers Chat with paper Marie Kmita, Basile Tarchini, Jozsef Zàkàny, Malcolm Logan, Clifford J. Tabin & Denis Duboule Nature volume 435, pages1113–1116 (2005) Published: 23 June 2005 https://www.nature.com/articles/nature03648 figure 2

15 November 2002 growth arrest specific gene 1 acts as a region-specific mediator of the Fgf10/Fgf8 regulatory loop in the limb Ying Liu, Chunqiao Liu, Yoshihiko Yamada, Chen-Ming Fan Author and article information Development (2002) 129 (22): 5289–5300.

Fig. 1. Gas1 transcripts are detected in developing limbs. Expression ofGas1 was examined by ISH. (A-C) Dorsal view of the forelimbs at E9.25, E9.5 and E10.5. Anterior (a) is at top and posterior (p) at bottom;flb, forelimb bud. Gas1 is expressed in the lateral plate mesoderm and asymmetrically in the limbs with higher levels anteriorly. (D-G)Whole-mount ISH of E11.5-E14.5 forelimbs shows expression in the autopod(dorsal view, anterior at top). White arrowheads indicate the interdigital regions; open arrowheads, perichondorgenic regions; asterisks, joints or prospective joints. (H-K) 35S-ISH of E10.5-E15.5 forelimbs(horizontal sections, anterior at top). (H) Superimposed images from adjacent sections of E10.5 Gas1 expression (red) in anterior two-thirds of the mesenchyme but not in AER (visualized by Fgf8 expression (green) in the adjacent section). At E12.5 (I), Gas1 transcripts (pink granules)are prominent in the prechondrogenic region (black arrowheads) and the interdigits (white arrowheads). At E13.5 (J), Gas1 is expressed in the interdigits (much weaker than at E12.5) and prospective joints(asterisks). At E15.5 (K), Gas1 is localized to perichondrium lining the joint cavities (asterisks).

ニワトリの中胚葉誘導と神経誘導シグナリング

 

 

ArticlePDF Available Chordin regulates primitive streak development and the stability of induced neural cells, but is not sufficient for neural induction in the chick embryo Save Related Papers Chat with paper March 1998Development 125(3):507-19 DOI:10.1242/dev.125.3.507

 

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0925477304001303

アフリカツメガエルの中胚葉誘導と神経誘導シグナリング

 

 

  1. Spemann organizer transcriptome induction by early beta-catenin, Wnt, Nodal, and Siamois signals in Xenopus laevis  Yi Ding, Diego Ploper, Eric A. Sosa, +5, and Edward M. De Robertis ederobertis@mednet.ucla.eduAuthors Info & Affiliations Contributed by Edward M. De Robertis, February 24, 2017 (sent for review January 17, 2017; reviewed by Juan Larraín and Stefano Piccolo) March 27, 2017 114 (15) E3081-E3090 https://doi.org/10.1073/pnas.1700766114 https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.1700766114 
  2. The Xenopus homeobox gene Twin mediates Wnt induction of Goosecoid in establishment of Spemann’s organizer Micheline N. Laurent,, Ira L. Blitz, Chikara Hashimoto, Ute Rothbacher, Ken W.-Y. Cho Author and article information Development 01 December 1997 A dorsal determinant model for establishment of Spemann’s organizer in the dorsal marginal zone. Dorsal determinants, perhaps components of the Wnt signaling pathway, are localized in the vegetal hemisphere of the unfertilized egg (left). During normal development, fertilization triggers the displacement of these determinants toward the future dorsal side (top right). We propose that cells comprising the prospective dorsal mesoendoderm directly inherit these determinants which activate a Wnt-signaling cascade to establish Spemann’s organizer. Activation of a Wnt-signaling cascade leads to establishment ofXtwn expression in the dorsal marginal zone. Xtwn directly binds to the Wnt-responsive element of the gsc promoter (the PE), and in collaboration with activin/BVg1-like signals, activates expression of gsc. Treatments that inhibit cortical rotation (e.g. UV irradiation) result in ‘trapping’ of the dorsal determinants (lower right) in the extreme vegetal endoderm. As a consequence of the lack of distribution of dorsal determinants to the dorsal side, the entire marginal zone becomes specified as ventral mesoderm, no organizer is formed and dorsal-specific marker genes are not expressed ‘dorsally’. Xtwn expression is instead found in the vegetal pole region. Abbr: VM, ventral mesoderm; IM, intermediate mesoderm; Org, organizer.