投稿者「PhD」のアーカイブ

医師向けの日本の雑誌

医学のあゆみ

診断と治療

臨床内科

総合診療

月刊　糖尿病

消化器・肝臓内科　科学評論社

消化器外科　へるす出版

2020年8月号　特集　英語論文作成のコツ

臨床眼科

看護実践の科学

生体の科学

実験医学

 

【論文の書き方】医学英語論文執筆のコツ　臨床研究の論文化　臨床論文の書き方のコツ

 

 

要点

  1. 臨床研究論文執筆の原則　森本剛（PDF)

論文の書き方に関する書籍

  1. Story, Not Study: 30 Brief Lessons to Inspire Health Researchers as Writers  Lorelei Lingard , Christopher Watling　https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-030-71363-8　邦訳があります。
  2. 英文誌のアクセプトがほしいなら、押さえるべきはココ！ 臨床論文の書き方 河井昌彦 2021年03月 金芳堂
  3. 臨床研究と論文作成のコツ―読む・研究する・書く　2011年7月　東京医学社

ーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーーー

消化器外科2020年8月号　特集　英語論文作成のコツ（へるす出版）
1．外科医が英語論文を書く際のハードルと克服法
名古屋大学大学院医学系研究科消化器外科学／神田 光郎
2．外科医が臨床論文を国際誌に投稿する意義
福島県立医科大学低侵襲腫瘍制御学講座／本多 通孝
3．英語論文執筆の指導法
国立がん研究センター中央病院大腸外科／志田 大
4．英語論文作成に必要なポイント
三重大学附属病院ゲノム診療部ゲノム診療科、三重大学大学院医学系研究科消化管・小児外科学講座　奥川 喜永　他
5．reviewerの視点からみた英語論文の書き方と戦略
虎の門病院消化器外科／進藤 潤一
6．効率的な英語論文作成法；抄録を書いたらすぐに論文化！
聖路加国際病院消化器・一般外科／海道 利実
7．英文論文作成の勧め
東京労災病院，杏林大学／杉山 政則
8．消化器外科学英語論文の書き方
東邦大学大学院消化器外科学講座／島田 英昭

【JSGS】消化器外科学論文の書き方 from JSGS on Vimeo.

 

臨床婦人科産科　Vol.74 No.11 今月の臨床　論文作成の戦略　アクセプトを勝ちとるために 医学書院
目次
アクセプトを目指した論文の書き方　濱西　潤三，万代　昌紀
■いまさら聞けない論文作成のキホン
題名・緒言（Title・Introduction）はどう書けば魅力的か？　馬淵　誠士，山中　彰一郎，市川　麻祐子
適切な統計解析の使い方　濱野　鉄太郎
図表作成のポイント　的場　優介，阪埜　浩司，青木　大輔
考察（Discussion）はどう書けば魅力的か？　梶山　広明
投稿するジャーナルの選定と査読の流れ－悪徳雑誌（ハゲタカジャーナル）の見分け方　澤田　健二郎
査読意見に対する回答の仕方　小林　陽一
■論文のまとめ方 : 実践編
症例報告の書き方－意義，症例選定，雑誌選定　高橋　宏典
臨床研究のまとめ方－研究デザインの設定から正しい結果の導き方まで　渡利　英道，金野　陽輔
基礎研究のまとめ方－実験計画の立案から論文作成まで　織田　克利
英文論文にチャレンジしよう！　初めて英文論文を書く人へのアドバイス　矢幡　秀昭，加藤　聖子
Cover letterはどう書けば魅力的か？　田中　良道
英文校正に求めるもの　太田　剛

非劣性試験 (noninferiority trials)

 

非劣性試験 (noninferiority trials)とは

The null hypothesis in non-inferiority trials is that new treatment is inferior to standard treatment. The alternative hypothesis is the new treatment is non-inferior to standard treatment. (Review Non-inferiority trials in cardiology: what clinicians need to know Heart BMJ Journals)

参考

  1. 同等性・非劣性の解析（新谷歩）連載2012.03.26　医学会新聞
  2. Reporting of Noninferiority and Equivalence Randomized Trials Extension of the CONSORT 2010 Statement
  3. Review Non-inferiority trials in cardiology: what clinicians need to know Heart (BMJ Journals) わかりやすい説明。

医学統計データを読む – 医学・医療に必要な統計学活用法 -　第3版

『医学統計データを読む』という医療統計の教科書があります。邦訳は2006年の刊行で今となってはやや古いのですが、題材を全て実際の医学論文からとっているため、統計学を学びたい医師研究者にとってはモチベーションが湧いて良いのではないかと思います。内容を大雑把にですが紹介したいと思います。統計を学ぶためには何かしっかりとした教科書を通読しておくのが良いと思います。
医学統計データを読む – 医学・医療に必要な統計学活用法 -　第3版
刊行年月　2006/5/1この邦訳はBasic & Clinical Biostatistics Fourth edition by Beth Dawson and Robert G. Trappの全訳です。監訳者序文によれば原書には、例題などで扱ったデータや統計ソフトウェアを収めたＣＤ－ＲＯＭが付属していますが、この訳書ではそれが省かれています。ちょっと残念ですね。
序文によれば本書の特徴は、実際の医学論文から題材が取られているところです。

臨床研究への序

医学論文では統計学的な手法が妥当ではない論文が大半であるということが紹介されています。例えばWilliamsonらが1992年に報告したものによれば、4235報のうちたったの20%しか妥当とはいえなかったとのこと。

  1. Williamson JW, Goldshmidt PG , Colton T: The quality of medical literature: And analysis of validation assessments. In bailar JC, Mosteller F (editors): Medical uses of Statistics . Massachusetts Medical Society, 1992.
  2. Medical Uses of Statistics 3rd Edition by John C. Bailar and David C. Hoaglin 編集　Wiley 2009 ISBN-13 : 978-0470439524 “Numerous examples based on studies taken directly from the pages of the New England Journal of Medicine“
  3. Medical Uses of Statistics 2nd Edition by Bailar and Mostelle. CRC Press 1992 ISBN-13 : 978-0910133364
  4. Medical Uses of Statistics by John C. Bailar III , Frederick Mosteller. New England Journal of Medicine. 1986 ISBN-13 : 978-0910133166

医学研究の研究デザイン

理学の分野の研究であれば、すなわち「実験研究」なわけですが、医学研究においては、「観察研究」と「実験研究」（介入を含む研究のこと）に大きく分けられます。観察研究はさらにいくつかに分類されます。医学で研究を計画する際にも、あるいは、医学研究の論文を読む際にもこういった実験のデザインが何かを理解しておくことが必須になります。

データの要約と表・グラフの提示

オッズ比

題材として取り上げられている論文とデータ

  • R A Ballard 1, P L Ballard, A Cnaan, J Pinto-Martin, D J Davis, J F Padbury, R H Phibbs, J T Parer, M C Hart, F L Mannino, S K Sawai.  Antenatal thyrotropin-releasing hormone to prevent lung disease in preterm infants. North American Thyrotropin-Releasing Hormone Study Group N Engl J Med . 1998 Feb 19;338(8):493-8. doi: 10.1056/NEJM199802193380802.  テーブル２　本文も無料。

データの推論に使用する確率と関連事項

 

1群についての研究課題

 

2つの個別・独立の群についての研究課題

 

3群以上の平均値についての研究課題

 

変数の関係についての研究課題

 

生存率の分析法

 

多変数の統計的手法

 

調査研究

 

エビデンス医療と決定分析の方法

 

医学論文を読む

参考

  1. 医学統計データを読む　第3版 – 医学・医療に必要な統計学活用法 -（メディカル・サイエンス・インターナショナル）医科統計学の好評入門テキスト、初の全訳
  2. 医学統計データを読む（版元ドットコム）目次

position paper （ポジションペーパー）とは？

ポジションペーパー

ポジションペーパーは、ある問題やアイデアに対して、賛成あるいは反対いずれであれ意見を述べるものです。特定の問題（トピック）について議論したり、再考を求めたりするために書かれます。（ポジションペーパー作成に大切な10のポイント On Sep 28, 2020　エナゴ）

Position Paper とは、議題に対する自国の立場や政策、およびそれらを支える論理を述べ
たものです。（Position Paper について　Japan Committee for Global Classrooms）

ARO? CRO? CRC? 治験、臨床試験、臨床研究の違い

臨床研究を推進するにあたり、様々な専門家や業務が絡んできます。略称が飛び交うことが多いため、門外漢には全く何のことかわかりません。主要な言葉をまとめておきます。

臨床研究

人を対象として行われる医学的な研究のこと。

臨床試験

臨床研究の中でも特に、薬等の安全性を調べるための治療を兼ねた研究のこと。

治験

臨床試験の中でも特に、新薬や新しい医療機器に関して国の承認を得るために行われる試験

ARO：Academic Research Organization（アカデミック臨床研究機関）

ＡＲＯの定義や使われ方は、状況に応じて狭かったり広かったりするようです。

ARO（AcademicResearchOrganization）大学や研究機関での研究を臨床研究（主に臨床試験や医師主導治験）として適切に実施できるように支援する組織（ARO-CRC 教育ツール 解説書）

 

Academic Research Organization （ARO）の定義　（新日本科学用語集）

  • 大学・研究所等のアカデミアにおいて臨床試験を推進、支援する組織
  • 大学（アカデミア）の有する多くの専門性や特徴を活用し、治験を収益事業として行う組 織

（臨床研究中核病院における支援機能研究者からみたARO機能の活用）

 

ARO：Academic Research Organizationの略。研究機関や医療機関等を有する大学等がその機能を活用して、医薬品開発等を含め、臨床研究・非臨床研究を支援する組織をいう。（ＡＭＥＤ）

 

ARO の説明を求められた時に CRO のアカデミック版であるとの回答は簡便であるが正確ではなく，実際にはシーズ（基礎技術）探索，ファンド獲得から臨床試験モニタリング，総括報告書作成等，およそ基礎技術から医薬品・医療機器・再生医療等製品を実用化する上で必要なあらゆるプロセスを受け持っている．（Academic Research Organization の役割　日本臨床外科学会雑誌 77 巻）

 

ＣＲＯ

CRO（Contract Research Organization、開発業務受託機関

 

CRC（臨床コーディネーター）

臨床コーディネーター（clinical research coordinator; CRC).

 

  1. 治験コーディネーター（または臨床研究コーディネーター）とは、治験に参加する患者さん(被験者)の人権や安全性を守り、科学性、信頼性の高い治験を円滑に進められるように管理・調整する専門スタッフのことです。…　当センターでは、薬剤師、看護師、臨床検査技師、管理栄養士などのスタッフがCRCとして治験実施のサポートをしています。（大阪市立大学医学部付属病院臨床研究・イノベーション推進センター）

 

 

SMO

SMO（Site Management Organization：治験施設支援機関）.

 

 

参考

  1. ＫＯＢＥものわすれネットワーク
  2. 医師主導臨床研究計画立案の要点 〜効果的な研究計画の実施のために〜 日本医師会 臨床研究教育WG

 

シノプシスとは？臨床研究におけるプロトコールのドラフトのこと

臨床研究に関する話題で、シノプシスという言葉が普通に出てきます。一般の世界では聞きなれない言葉ですが、シノプシスとはいったい何でしょうか？

シノプシスとは

研究概要（シノプシス）は、臨床試験の重要な部分の抜粋（サマリー）です。…　シノプシスは、読者がプロトコルの全文を読まずに、何（what）、なぜ（why）、どこ（where）、どのように（how）研究を実施するか主要なポイントについて理解することが出来ます。出典：臨床研究のプロトコルの概要を効果的なものにするための、５つの秘訣 by Dr. Dean Meyer　Edanz-Learning-Japan April 17, 2020

シノプシスの中身

プロトコルシノプシスに最低限記載すべき項目
・研究目的
・研究デザイン
・対象集団（選択基準・除外基準）
・症例数
・エンドポイント

参考：医師主導臨床研究計画立案の要点 〜効果的な研究計画の実施のために〜 日本医師会 臨床研究教育WG

 

参考

  1. 臨床研究関連資料（各種ひな形）

 

ダークマターとは？

名前だけはよく耳にするダークマターですが、いったいダークマター（暗黒物質）とは何でしょうか？

ダークマターとは？

宇宙を構成するものの割合：物質5％、ダークマター27％、、ダークエネルギー68％　（第６回：ダークマターを捕まえる　2014年4月　素粒子宇宙期限研究帰国　名古屋大学）

ダークマターとの検出

僕たちはダークマターにはね飛ばされた原子核の飛跡をフィルムで捕らえます。（第６回：ダークマターを捕まえる　2014年4月　素粒子宇宙期限研究帰国　名古屋大学）

薬物動態学（pharmacokinetics）

薬物(drug)とは

生体に対して影響を与える化学物質の総称（ウィキペディア）。

薬物動態とは

薬が体に吸収され、体のどこかに分布し、代謝され排泄される一連の動き。

1コンパートメントモデルと2コンパートメントモデル

コンパートメント、1コンパートメントモデル、2コンパートメントモデルというのは、薬理学独特の用語です。

  1. 臨床薬物動態学　http://www-user.yokohama-cu.ac.jp
  2. 第14章　薬物動態学　14.1 コンパートメントモデル
  3. 麻酔薬の薬物動態
  4. 線形1－コンパートメントモデル　yaku-tik.com
  5. 線形2－コンパートメントモデル　yakugaku-tik.com
  6. 静注2コンパートメントモデル　我楽多頓陳館

ground truthとは？正解データのこと

コンピューターサイエンスの論文でground truth imagesという言葉が出てきて、「何それ？」と思いました。ground truthというのは、もともとはリモートセンシングの領域で使われる言葉のようです。衛星写真で地上を撮影したときにその画像のピクセルが意味するものは地上では何か？ということのようです。リンゴの果樹園なのか、田んぼなのか、砂漠なのかといったことでしょうか。ウィキペディアによれば、推測されたものでなく、実際に観察されたものという解説でした。

Ground truth is a term used in various fields to refer to information provided by direct observation (i.e. empirical evidence) as opposed to information provided by inference.  (Wikipedia)

機械学習の分野では、教師有学習で使われる「正解のわかったデータ」ということのようです。